RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8922F6XVS9 199 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PurbO35295 324 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pdk4O70571 412 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RpsaP14206 295 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il1rl1P14719 567 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbp1Q00915 135 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdk16Q04735 496 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 E2f5Q61502 335 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam149b1Q6NSV7 578 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stkld1Q80YS9 662 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dlk2Q8K1E3 382 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sash3Q8K352 380 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acsf2Q8VCW8 615 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ing3Q8VEK6 421 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1502Q8VG66 316 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q91Z58 1206 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ggt7Q99JP7 662 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acbd6Q9D061 282 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tssc4Q9JHE7 317 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Magel2Q9QZ04 1284 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3164L7N2B9 238 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3264L7N2C5 238 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lamp2P17047 415 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpatch4Q3TFK5 415 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Echdc2Q3TLP5 296 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gsdmc4Q3TR54 480 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdkl4Q3TZA2 342 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lipo3Q3UT41 399 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Otol1Q4ZJM7 482 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fnip2Q80TD3 1108 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcmtd2Q8BHD8 359 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CntrobQ8CB62 887 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akr1c20Q8VC77 323 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MydgfQ9CPT4 166 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Themis3Q9CU24 569 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spatc1lQ9D9W0 342 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ap2b1Q9DBG3 937 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akr1a1Q9JII6 325 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ak1Q9R0Y5 194 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Iqcj-Schip1A0A088MLT8 559 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syndig1A2ANU3 258 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A530032D15RikE9Q422 215 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dpysl4O35098 572 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Schip1P0DPB4 484 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CiitaP79621 1155 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RelaQ04207 549 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rgs9bpQ148R9 237 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LnpkQ7TQ95 425 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmtc3Q8BRH0 920 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ItchQ8C863 864 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PapolbQ9WVP6 641 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ror1Q9Z139 937 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RptorQ8K4Q0 1335 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myh2G3UW82 1942 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 L3mbtl1A2A5N8 826 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim30bE9PVL6 203 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Impa1O55023 277 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Traf2P39429 501 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MipP51180 263 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpina6Q06770 397 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700061G19RikQ08EE8 705 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnk9Q3LS21 402 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Soat1Q61263 540 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CochQ62507 552 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r12bQ8BG95 976 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5591Q8CDK1 855 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nrbf2Q8VCQ3 287 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pdxdc1Q99K01 787 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CmasQ99KK2 432 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Decr1Q9CQ62 335 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scnn1bQ9WU38 638 aa13.09□□□□□ -0.31
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4933424G06RikA0A140LIP3 267 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gbp4A4UUI3 631 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aldoart1A6ZI46 419 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2b19O55071 492 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smpdl3aP70158 445 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rap1gap2Q5SVL6 712 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Traf3Q60803 567 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcns3Q8BQZ8 491 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Setd7Q8VHL1 366 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dlg2Q91XM9 852 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp655Q9CZP3 541 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mpp6Q9JLB0 553 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ms4a4aA0A087WRT7 236 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8897L7N294 181 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kng1O08677 661 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Per3O70361 1113 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ArvcfP98203 962 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grik1Q60934 836 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Morc4Q8BMD7 928 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Samd7Q8C8Y5 445 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cybrd1Q925G2 290 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Btbd19S4R1I0 287 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Skint7A7XV04 395 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cacna2d1O08532 1103 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HmbsP22907 361 aa13.08□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Epha3P29319 983 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.8 ms