RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628368.1

CPS1-IT1-201, CPS1 intronic transcript 1, humanhuman

BASIC

Gene CPS1-IT1, Length 2,306 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-IT1-201ENST00000628368 GALNT2Q10471 571 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 AP1B1Q10567 949 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 WASHC5Q12768 1159 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TWF1Q12792 350 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 KCNJ11Q14654 390 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TTMPQ5BVD1 217 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CEP85LQ5SZL2 805 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PIK3R6Q5UE93 754 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ZNF683Q8IZ20 524 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CCNYQ8ND76 341 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 P2RY11Q96G91 374 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ETNK1Q9HBU6 452 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 NINJ2Q9NZG7 142 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 NUP205Q92621 2012 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 A0A0A0MRY4 1105 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 RNF103O00237 685 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CHADO15335 359 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TLL1O43897 1013 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 METTL18O95568 372 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ACSL3O95573 720 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CXCL14O95715 111 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 APOEP02649 317 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SPATA31D3P0C874 917 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 MYZAPP0CAP1 466 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ELF1P32519 619 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SERPINB6P35237 376 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CBLBQ13191 982 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 HIF1AQ16665 826 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 MSS51Q4VC12 460 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 MS4A13Q5J8X5 152 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 HECTD3Q5T447 861 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 LILRA6Q6PI73 481 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CENPUQ71F23 418 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TBC1D31Q96DN5 1066 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 BTN2A3PQ96KV6 586 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 C9orf72Q96LT7 481 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SPATA13Q96N96 652 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 BRD8Q9H0E9 1235 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TMBIM4Q9HC24 238 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SAYSD1Q9NPB0 183 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 DNMT3LQ9UJW3 386 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 INSL5Q9Y5Q6 135 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 WASH4PA8MWX3 477 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 E7ESA3 106 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 COCHO43405 550 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TGM5O43548 720 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 OPHN1O60890 802 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 BANF1O75531 89 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 STK10O94804 968 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 APRTP07741 180 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 HMBSP08397 361 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 MX2P20592 715 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 BMPR1AP36894 532 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 GARSP41250 739 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 KCNQ1P51787 676 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 EPHB3P54753 998 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 GYS2P54840 703 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ARL4CP56559 192 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ERVFC1P60507 584 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 IFFO1Q0D2I5 559 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PLD1Q13393 1074 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 AUHQ13825 339 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 VEPH1Q14D04 833 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TAF12Q16514 161 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SYCP2LQ5T4T6 812 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms