RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 OLFM3Q96PB7 478 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC9A7Q96T83 725 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MED10Q9BTT4 135 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 DUSP16Q9BY84 665 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CD248Q9HCU0 757 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GGT7Q9UJ14 662 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GRID1Q9ULK0 1009 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 FZD10Q9ULW2 581 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SDR42E2A6NKP2 422 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA8RI6L899 631 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 AP3B1O00203 1094 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 HAS3O00219 553 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF103O00237 685 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NCAM2O15394 837 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC6O75061 913 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 DGKIO75912 1065 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PDGFRBP09619 1106 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 AKAP5P24588 427 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GPC1P35052 558 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RGS2P41220 211 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ETV4P43268 484 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 LHX1P48742 406 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GLUD2P49448 558 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNJ2P63252 427 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GBE1Q04446 702 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MGAT5Q09328 741 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ADIGQ0VDE8 80 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CLN3Q13286 438 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TBCCQ15814 346 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 UNC5AQ6ZN44 842 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PIGZQ86VD9 579 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB106AQ8N104 65 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP24Q8N264 748 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC185Q8N715 623 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SH3TC2Q8TF17 1288 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF139Q8WU17 664 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SOCS4Q8WXH5 440 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 WNT8BQ93098 351 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NTAN1Q96AB6 310 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SERAC1Q96JX3 654 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 C7orf26Q96N11 449 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM111AQ96PZ2 611 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC2A13Q96QE2 648 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 WWP1Q9H0M0 922 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC17A7Q9P2U7 560 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CHKBQ9Y259 395 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 STK38LQ9Y2H1 464 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 IPPQ9Y573 584 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0G2JND7 137 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR91A4D1P6 747 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 E7ENQ6 273 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CYB561D2O14569 222 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CAPN9O14815 690 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC22O60826 627 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 GLRA3O75311 464 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT16P08779 473 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 FGFR1P11362 822 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MX2P20592 715 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CRHR1P34998 444 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SERPINB6P35237 376 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP2K2P36507 400 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 C1QTNF8P60827 252 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 COG7P83436 770 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 DEUP1Q05D60 604 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SCAPQ12770 1279 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT72Q14CN4 511 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB6CQ53S08 254 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 WASHC2DQ5SRD0 308 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 UBXN11Q5T124 520 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 FAXCQ5TGI0 409 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 164.5 ms