RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		22.53	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	ACACB	O00763	2458 aa		22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	EPHB6	O15197	1021 aa		22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	NOS2	P35228	1153 aa		22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	CSK	P41240	450 aa		22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	JAM2	P57087	298 aa		22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	MYL5	Q02045	173 aa		22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	CDH18	Q13634	790 aa		22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	NCAPH	Q15003	741 aa		22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	PPM1J	Q5JR12	505 aa		22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	CHSY1	Q86X52	802 aa		22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF366	Q8N895	744 aa		22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	NT5C3B	Q969T7	300 aa		22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	22.52	■■□□□ 1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	C4orf47	A7E2U8	309 aa		22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF18	P17022	549 aa		22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	SCNN1A	P37088	669 aa		22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	MATK	P42679	507 aa		22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF3	Q5VWG9	929 aa		22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	XYLT1	Q86Y38	959 aa		22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	NPY6R	Q99463	290 aa		22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		22.51	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		22.5	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200		F5H5T6	163 aa		22.5	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFS2	O75306	463 aa		22.5	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	MME	P08473	750 aa		22.5	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCB4	P21439	1286 aa		22.5	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	22.5	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		22.5	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	C18orf8	Q96DM3	657 aa		22.5	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		22.5	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		22.5	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	COX16	Q9P0S2	106 aa		22.5	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		22.5	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200		M0QYT0	321 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	ASL	P04424	464 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	TPM2	P07951	284 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	OXTR	P30559	389 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	NOMO3	P69849	1222 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	NME3	Q13232	169 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	MTA1	Q13330	715 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	ARID5B	Q14865	1188 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXL22	Q6P050	247 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	ERICH1	Q86X53	443 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	CACUL1	Q86Y37	369 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM1B	Q8NB78	822 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP76	Q8TAP6	659 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	FBRS	Q9HAH7	460 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPN10	Q9HC96	672 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGV	Q9NUD9	493 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	RRN3	Q9NYV6	651 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	KNL1	Q8NG31	2342 aa		22.49	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	LGALS16	A8MUM7	142 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200		H0Y626	953 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200		I6L893	689 aa	Predicted RBP	22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINF2	P08697	491 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	CXCR3	P49682	368 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	C2CD6	Q53TS8	623 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF677	Q86XU0	584 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	APCDD1	Q8J025	514 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXJ1	Q92949	421 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF34	Q969K3	372 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	MTG2	Q9H4K7	406 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	SUN2	Q9UH99	717 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GVM2	712 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	GFPT2	O94808	682 aa		22.48	■■□□□ 1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	ADRB1	P08588	477 aa		22.48	■■□□□ 1.19

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