RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560715.5

TSPAN3-209, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 2,892 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-209ENST00000560715 SOCS5O75159 536 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 ENDOD1O94919 500 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 FTCDO95954 541 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 CCT8P50990 548 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 MGAT5Q09328 741 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 SEC23AQ15436 765 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 RSPH3Q86UC2 560 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 RFFLQ8WZ73 363 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 LPIN2Q92539 896 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 CALML4Q96GE6 196 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 C7orf26Q96N11 449 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 DECR2Q9NUI1 292 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 COL20A1Q9P218 1284 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 HSF4Q9ULV5 492 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 A0A1W2PQJ5 194 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 CES2O00748 559 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 COL6A2P12110 1019 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 S100A1P23297 94 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 GPR85P60893 370 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 PHC1P78364 1004 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 SGCGQ13326 291 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 SNX17Q15036 470 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 POU4F3Q15319 338 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 MED22Q15528 200 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 LRRC24Q50LG9 513 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 CROCCP2Q86T23 111 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 NLRP10Q86W26 655 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 SCAIQ8N9R8 606 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 TLE6Q9H808 572 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 SOX13Q9UN79 622 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 CAPN9O14815 690 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 PDE5AO76074 875 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 TPPPO94811 219 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 CD3EP07766 207 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 CSF1P09603 554 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 CPB1P15086 417 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 PAMP19021 973 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 MARK3P27448 753 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 EPHB2P29323 1055 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 RASSF2P50749 326 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 TIMM10P62072 90 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 HLFQ16534 295 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 KLHL35Q6PF15 583 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 Q6ZNX1 250 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 SEC14L1Q92503 715 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 RGMAQ96B86 450 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 NACC2Q96BF6 587 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM89AQ96GI7 184 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 DYDC2Q96IM9 177 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM84AQ96KN4 292 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms