RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	C14orf80	Q86SX3	495 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	C11orf74	Q86VG3	221 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	EMC1	Q8N766	993 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	TTC17	Q96AE7	1141 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	MYO19	Q96H55	970 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SPACA7	Q96KW9	195 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SYT11	Q9BT88	431 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	RRN3	Q9NYV6	651 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		21.58	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CSK	P41240	450 aa		21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	STARD3	Q14849	445 aa		21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	RAB6C	Q53S08	254 aa		21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		21.57	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	GDF9	O60383	454 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	EPHX1	P07099	455 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	PTGER3	P43115	390 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	NUMB	P49757	651 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CREB5	Q02930	508 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	LMNB2	Q03252	620 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ARC	Q7LC44	396 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	TCEAL3	Q969E4	200 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	AGPAT1	Q99943	283 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	MTG2	Q9H4K7	406 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		21.56	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CKAP5	Q14008	2032 aa		21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PQC6	194 aa		21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ZNF806	P0C7X5	589 aa		21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ID4	P47928	161 aa		21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	DEUP1	Q05D60	604 aa		21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	NR1I3	Q14994	352 aa		21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CACUL1	Q86Y37	369 aa		21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	APCDD1	Q8J025	514 aa		21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		21.55	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996		H0Y626	953 aa		21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	FER	P16591	822 aa		21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	C5orf22	Q49AR2	442 aa		21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	MON1B	Q7L1V2	547 aa		21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	DEFB119	Q8N690	84 aa		21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	SIK2	Q9H0K1	926 aa		21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	WDCP	Q9H6R7	721 aa		21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	21.54	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	21.54	■■□□□ 1.04

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