RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517052.1

RNU6-448P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 448, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-448P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-448P-201ENST00000517052 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 EMSYQ7Z589 1322 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP0.86□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A1B0GUV1 79 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PLSCR5A0PG75 271 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRR23AA6NEV1 266 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR2W5A6NFC9 320 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CLCA1A8K7I4 914 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 BECN2A8MW95 431 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 VSTM5A8MXK1 200 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 BTBD18B2RXH4 712 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 INAFM1C9JVW0 142 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 RHODO00212 210 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 MDM4O15151 490 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 DHHO43323 396 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 THAP12O43422 761 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 COQ9O75208 318 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 KAT7O95251 611 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 LDLRP01130 860 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRSS2P07478 247 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 SP1P08047 785 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CPA1P15085 419 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC5A2P31639 672 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC8A1P32418 973 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CIITAP33076 1130 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 KRT2P35908 639 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 RFX2P48378 723 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CLCN5P51795 746 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC37A1P57057 533 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 POU5F1BQ06416 359 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 Q0VFX4 171 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 COASYQ13057 564 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ATP1A4Q13733 1029 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 DAG1Q14118 895 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 GBX1Q14549 363 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PPP2R5AQ15172 486 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 SHBQ15464 509 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ODR4Q5SWX8 454 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAXCQ5TGI0 409 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 RAP1GAP2Q684P5 730 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ISM2Q6H9L7 571 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 HMBOX1Q6NT76 420 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 MRNIPQ6NTE8 343 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ADAM5Q6NVV9 412 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 TLDC1Q6P9B6 456 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 C16orf89Q6UX73 402 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 GPSM1Q86YR5 675 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CCDC28AQ8IWP9 274 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 DDIASQ8IXT1 998 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 RNF152Q8N8N0 203 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRR26Q8N8Z3 221 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 EXD3Q8N9H8 876 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM47BQ8NA70 645 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ATP11CQ8NB49 1132 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 C7orf57Q8NEG2 295 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR52N4Q8NGI2 321 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 OVCA2Q8WZ82 227 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 NPIPB3Q92617 1050 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 KAT2AQ92830 837 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PHKBQ93100 1093 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 IQCDQ96DY2 449 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 LRRC46Q96FV0 321 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CLMNQ96JQ2 1002 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 GPR78Q96P69 363 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF347Q96SE7 839 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 EPYCQ99645 322 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 HTATIP2Q9BUP3 242 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 APOL5Q9BWW9 433 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 SPRY4Q9C004 299 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 TRIM2Q9C040 744 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 BTBD1Q9H0C5 482 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 TASP1Q9H6P5 420 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAP6D1Q9H9H5 199 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMOD4Q9NZQ9 345 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 KCNG2Q9UJ96 466 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 EID1Q9Y6B2 187 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 LMTK3Q96Q04 1460 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A1B0GVT2 93 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A1W2PPC4 97 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 GXYLT2A0PJZ3 443 aa0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms