RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CHST13	Q8NET6	341 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SCFD2	Q8WU76	684 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	KRT35	Q92764	455 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC5A5	Q92911	643 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ATG4C	Q96DT6	458 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	IFT74	Q96LB3	600 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	C7orf26	Q96N11	449 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP6V0B	Q99437	205 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RIT2	Q99578	217 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PANK2	Q9BZ23	570 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	AURKC	Q9UQB9	309 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PASK	Q96RG2	1323 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1W2PPH5	198 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1W2PPL8	197 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC78	A2IDD5	438 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HEATR9	A2RTY3	570 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TARM1	B6A8C7	271 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF103	O00237	685 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PLD2	O14939	933 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FOXN1	O15353	648 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	MSH4	O15457	936 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	AOC2	O75106	756 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMD10	O75832	226 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PIAS2	O75928	621 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ZBED1	O96006	694 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PNP	P00491	289 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	OPN1LW	P04000	364 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RET	P07949	1114 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CLTB	P09497	229 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ALAD	P13716	330 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CTRB1	P17538	263 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	IL11	P20809	199 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	GAL	P22466	123 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CHM	P24386	653 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NFKBIA	P25963	317 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RPA1	P27694	616 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PPM1A	P35813	382 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CLCN4	P51793	760 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	EPHA4	P54764	986 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB14	P61106	215 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PDE1B	Q01064	536 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	KDSR	Q06136	332 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	GRB10	Q13322	594 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CAMK2D	Q13557	499 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	MOG	Q16653	247 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR142	Q7Z601	462 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TRPV1	Q8NER1	839 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	IFT81	Q8WYA0	676 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RFK	Q969G6	155 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		6.97	□□□□□ -1.29

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