RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF40O75150 1001 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 14.3
SH3BP2-208ENST00000504294 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 FECHP22830 423 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 HOXA6P31267 233 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 L1CAMP32004 1257 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 NNMTP40261 264 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 HDAC4P56524 1084 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ST8SIA6P61647 398 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 KRT83P78385 493 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 C6orf118Q5T5N4 469 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TRNP1Q6NT89 227 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF783Q6ZMS7 281 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SYT13Q7L8C5 426 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 C12orf40Q86WS4 652 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CARNMT1Q8N4J0 409 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 NIPA2Q8N8Q9 360 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC112Q8NEF3 446 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 USP33Q8TEY7 942 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 EPAS1Q99814 870 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 NUP85Q9BW27 656 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ZYG11BQ9C0D3 744 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ELOVL2Q9NXB9 296 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 GGA2Q9UJY4 613 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 VANGL2Q9ULK5 521 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 NENFQ9UMX5 172 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM170AA1A519 330 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 E9PAM4 449 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 LCA5LO95447 670 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MAGEA1P43355 309 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MRE11P49959 708 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 DGKEP52429 567 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PLK1P53350 603 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MTAPQ13126 283 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ERMARDQ5T6L9 678 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PHTF2Q8N3S3 785 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 KDM1BQ8NB78 822 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 GRPEL1Q9HAV7 217 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCB8Q9NUT2 735 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MMP17Q9ULZ9 603 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 GJB6O95452 261 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 NTSR1P30989 418 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 STARD3Q14849 445 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TCEAL1Q15170 157 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CHPFQ8IZ52 775 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 RFFLQ8WZ73 363 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CIPCQ9C0C6 399 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 FBRSQ9HAH7 460 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SUN2Q9UH99 717 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 FZD10Q9ULW2 581 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SRGAP2O75044 1071 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 NDUFA10O95299 355 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 KRT7P08729 469 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 RHOQP17081 205 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 OR1E1P30953 314 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MAN1A1P33908 653 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CNR2P34972 360 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TIE1P35590 1138 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC1A1P43005 524 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MAPKAPK2P49137 400 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SEC13P55735 322 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ANGPT1Q15389 498 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 C2orf27AQ580R0 203 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SPC24Q8NBT2 197 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms