RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	NPHP1	O15259	732 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CD63	P08962	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PCP4	P48539	62 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	GHRHR	Q02643	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CFHR1	Q03591	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PDCL	Q13371	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PIGS	Q96S52	555 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	NPAS1	Q99742	590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284		B9A039	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	TP73	O15350	636 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	TGM2	P21980	687 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	BIRC3	Q13489	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	STIM1	Q13586	685 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	KAT2B	Q92831	832 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	GRM8	O00222	908 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	TK1	P04183	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	TFEB	P19484	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ABCG1	P45844	678 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	MCM2	P49736	904 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ACTR2	P61160	394 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62	1e-8	■■■□□ 16
PTPRK-215	ENST00000498284	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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