RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	GRK6	P43250	576 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	TPMT	P51580	245 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2J2	P51589	502 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	BIRC3	Q13489	604 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	E2F5	Q15329	346 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	INAVA	Q3KP66	663 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	DHRS13	Q6UX07	377 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CGRRF1	Q99675	332 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	PANK2	Q9BZ23	570 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM9	Q9C026	710 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CIPC	Q9C0C6	399 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNJ18	B7U540	433 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	NPC1	O15118	1278 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHX1	P07099	455 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ATIC	P31939	592 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	IL12RB1	P42701	662 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF132	P52740	706 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K7CL	P57077	242 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	MYL6	P60660	151 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF19	Q2TAC6	998 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF699	Q32M78	642 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP135	Q66GS9	1140 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF605	Q86T29	641 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	NXPE2	Q96DL1	559 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	AK5	Q9Y6K8	562 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	PLK4	O00444	970 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPN9	O14815	690 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	MDM4	O15151	490 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CYBB	P04839	570 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CISD3	P0C7P0	127 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC130	P13994	396 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	JUP	P14923	745 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	HNF1B	P35680	557 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	GATA4	P43694	442 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CCT8	P50990	548 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	BNC1	Q01954	994 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMG2	Q02383	582 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMD6	Q15008	389 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ACOT1	Q86TX2	421 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	TMX3	Q96JJ7	454 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	IL37	Q9NZH6	218 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM92A	A1XBS5	289 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511		E9PAM4	449 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNK3	O14649	394 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CLIC2	O15247	247 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF20A	O95235	890 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM200B	P0CF97	657 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	RARG	P13631	454 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	P4HA1	P13674	534 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	EDN3	P14138	238 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ITPKB	P27987	946 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ADORA2B	P29275	332 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CHKA	P35790	457 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	MFAP3	P55082	362 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP11A	P98196	1134 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	IL9R	Q01113	521 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP24A1	Q07973	514 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ORC1	Q13415	861 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	FUK	Q8N0W3	1084 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	PDILT	Q8N807	584 aa		11.36	□□□□□ -0.59

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