RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 TRIM11Q96F44 468 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 LMLNQ96KR4 655 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ACOX2Q99424 681 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 IER2Q9BTL4 223 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ANKRD62A6NC57 917 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 E9PAM4 449 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 K7ESF4 209 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 SGK1O00141 431 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ADAM23O75077 832 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CYP1A2P05177 515 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 SP9P0CG40 484 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 TDGF1P13385 188 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.982e-8■■■■□ 25.6
PKP4-216ENST00000495123 ADRA1BP35368 520 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 WASP42768 502 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CXCL12P48061 93 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 NUMBP49757 651 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CCR3P51677 355 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 DMWDQ09019 674 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 LMAN2Q12907 356 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 MTA1Q13330 715 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 FUT11Q495W5 492 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 C5orf22Q49AR2 442 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ALFQ53S48 1182 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CHST9Q7L1S5 443 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ADIPOR2Q86V24 386 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ALLCQ8N6M5 410 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 SPC24Q8NBT2 197 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 OR52K2Q8NGK3 314 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 FIBINQ8TAL6 211 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 SORCS1Q8WY21 1168 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 BTBD6Q96KE9 485 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CCDC42Q96M95 316 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 HAPLN3Q96S86 360 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 PEBP4Q96S96 227 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 PRRX2Q99811 253 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CNPY3Q9BT09 278 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 NUP85Q9BW27 656 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 KCNH6Q9H252 994 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 GGA2Q9UJY4 613 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 SCINQ9Y6U3 715 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 DRGXA6NNA5 263 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 FAM72CH0Y354 149 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 H0Y626 953 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 MAP3K7O43318 606 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 SRGAP2O75044 1071 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ATG13O75143 517 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CNTN5O94779 1100 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CDC25BP30305 580 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CSKP41240 450 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CDH18Q13634 790 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 DMC1Q14565 340 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ARL13BQ3SXY8 428 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 RABGAP1LQ5R372 815 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 SYT13Q7L8C5 426 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 SLFN11Q7Z7L1 901 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 FAM72BQ86X60 149 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 APCDD1Q8J025 514 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 NTAN1Q96AB6 310 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ACDQ96AP0 544 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.92□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 C1orf74Q96LT6 269 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms