RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495082.5

SLC13A3-211, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC13A3, Length 1,887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-211ENST00000495082 VANGL2Q9ULK5 521 aa11.87□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF510Q9Y2H8 683 aa11.87□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 F5H5T6 163 aa11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 LEFTY2O00292 366 aa11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 MCF2LO15068 1137 aa11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 ITGAVP06756 1048 aa11.86□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 LMNB2Q03252 620 aa11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 GBE1Q04446 702 aa11.86□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 NLRP14Q86W24 1093 aa11.86□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 KIAA1958Q8N8K9 716 aa11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 ATL2Q8NHH9 583 aa11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 OLFM3Q96PB7 478 aa11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 LRRC1Q9BTT6 524 aa11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 TDP1Q9NUW8 608 aa11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 DTLQ9NZJ0 730 aa11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 CFAP97Q9P2B7 532 aa11.86□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 AMACRQ9UHK6 382 aa11.86□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 E2F8A0AVK6 867 aa11.85□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 GFRA2O00451 464 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 RAD51CO43502 376 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 MFSD11O43934 449 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 FSHRP23945 695 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 SLC6A4P31645 630 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 DR1Q01658 176 aa11.85□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 SNX1Q13596 522 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 NPNTQ6UXI9 565 aa11.85□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 LZTR1Q8N653 840 aa11.85□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 GRK7Q8WTQ7 553 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 IGSF8Q969P0 613 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 PNKPQ96T60 521 aa11.85□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 S1PR5Q9H228 398 aa11.85□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa11.85□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 HACD1B0YJ81 288 aa11.85□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 ECEL1O95672 775 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 RBP3P10745 1247 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 PTGIRP43119 386 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 KCNJ1P48048 391 aa11.85□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 POTEHQ6S545 545 aa11.85□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 LGI2Q8N0V4 545 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 NPWQ8N729 165 aa11.85□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 RUBCNQ92622 972 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 ZSWIM3Q96MP5 696 aa11.85□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 GDE1Q9NZC3 331 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 MPP6Q9NZW5 540 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.85□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 REV3LO60673 3130 aa11.84□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 TBX10O75333 385 aa11.84□□□□□ -0.51
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SLC13A3-211ENST00000495082 PRAMEF12O95522 483 aa11.84□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 GAS8O95995 478 aa11.84□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 TUBBP07437 444 aa11.84□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 MAPKAPK2P49137 400 aa11.84□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 USP4Q13107 963 aa11.84□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 PDK1Q15118 436 aa11.84□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF77Q15935 545 aa11.84□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 ALFQ53S48 1182 aa11.84□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 ATAT1Q5SQI0 421 aa11.84□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 AFMIDQ63HM1 303 aa11.84□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 CES5AQ6NT32 575 aa11.84□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 RFWD3Q6PCD5 774 aa11.84□□□□□ -0.51
SLC13A3-211ENST00000495082 JAMLQ86YT9 394 aa11.84□□□□□ -0.51
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