RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489537.5

SF3A3-208, Transcript of splicing factor 3a subunit 3, human

TSL 4

Gene SF3A3, Length 891 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3A3-208	ENST00000489537	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	LRRC31	Q6UY01	552 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	RFX8	Q6ZV50	586 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	LINC00523	Q86TU6	105 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	NUP93	Q8N1F7	819 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	CDKL2	Q92772	493 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	LPP	Q93052	612 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	RNF34	Q969K3	372 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	MYLPF	Q96A32	169 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	C1orf74	Q96LT6	269 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	SPATA13	Q96N96	652 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	SMO	Q99835	787 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	HIPK3	Q9H422	1215 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	DDIT4	Q9NX09	232 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	SCML2	Q9UQR0	700 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	TLDC2	A0PJX2	215 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	EBAG9	O00559	213 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	KCNN4	O15554	427 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	KRT37	O76014	449 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	BAIAP3	O94812	1187 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	AMH	P03971	560 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	FGFR3	P22607	806 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	BDNF	P23560	247 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	MMP13	P45452	471 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	SERPINB9	P50453	376 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	GNGT1	P63211	74 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	RING1	Q06587	406 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	DNAJC3	Q13217	504 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	GPR17	Q13304	367 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	PLD1	Q13393	1074 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	TRADD	Q15628	312 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	ANO4	Q32M45	955 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	USP41	Q3LFD5	358 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	TTMP	Q5BVD1	217 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	TPGS2	Q68CL5	300 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	STKLD1	Q8NE28	680 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	FATE1	Q969F0	183 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	MTBP	Q96DY7	904 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	PEBP4	Q96S96	227 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	PKMYT1	Q99640	499 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	HINFP	Q9BQA5	517 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	EPN3	Q9H201	632 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	MIOS	Q9NXC5	875 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SF3A3-208	ENST00000489537	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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