RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 KRT1P04264 644 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 HMBSP08397 361 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 HOXC13P31276 330 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 CDH6P55285 790 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 TDGQ13569 410 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 TFDP2Q14188 446 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 TAZQ16635 292 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 TFDP3Q5H9I0 405 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 MS4A13Q5J8X5 152 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 FAM78AQ5JUQ0 283 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 RABGAP1LQ5R372 815 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 DENND1CQ8IV53 801 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 KIAA2013Q8IYS2 634 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 BPIFB1Q8TDL5 484 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 KRT35Q92764 455 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 FAF2Q96CS3 445 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D31Q96DN5 1066 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 ZSWIM3Q96MP5 696 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 OSBPL9Q96SU4 736 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 PCDH18Q9HCL0 1135 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 SMPD4Q9NXE4 827 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 WASH4PA8MWX3 477 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 DAPK3O43293 454 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 NARSO43776 548 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 TJP3O95049 919 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 KLKB1P03952 638 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 CYBBP04839 570 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 TCF4P15884 667 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 TACR2P21452 398 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 OXCT1P55809 520 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 TPI1P60174 286 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 DPYSL3Q14195 570 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 PDGFRLQ15198 375 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 MPPE1Q53F39 396 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 RAB6CQ53S08 254 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 KCNT1Q5JUK3 1230 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 MANEALQ5VSG8 457 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 DENND4AQ7Z401 1863 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 CHSY1Q86X52 802 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 MFSD6LQ8IWD5 586 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 RASGEF1CQ8N431 466 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 LZTR1Q8N653 840 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 ACTRT1Q8TDG2 376 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 TSC1Q92574 1164 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 ALG3Q92685 438 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 MYADMQ96S97 322 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 ZYG11BQ9C0D3 744 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 SIK2Q9H0K1 926 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 RAB6CQ9H0N0 254 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 KCNK12Q9HB15 430 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 DUSP12Q9UNI6 340 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 RAD54BQ9Y620 910 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 HS3ST4Q9Y661 456 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 R4GN57 208 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 CEP250Q9BV73 2442 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 NOTCH4Q99466 2003 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 E9PAM4 449 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 ANHXE9PGG2 379 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 GFRA2O00451 464 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 ENC1O14682 589 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 CLDN11O75508 207 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 PRAMEF12O95522 483 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 LMNAP02545 664 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 IRF1P10914 325 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 PYGMP11217 842 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 RHOQP17081 205 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 PSMC3P17980 439 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 GJC1P36383 396 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 CDKN2BP42772 138 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 PAFAH1B1P43034 410 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 ZXDBP98169 803 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 AMPD2Q01433 879 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 FCHO2Q0JRZ9 810 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 NR1H3Q13133 447 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 AUHQ13825 339 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 SMTNL2Q2TAL5 461 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 PIK3R6Q5UE93 754 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 RFX8Q6ZV50 586 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-211ENST00000488243 CHST9Q7L1S5 443 aa12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms