RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474409.1

CNN3-205, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CNN3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-205ENST00000474409 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 STOML2Q9UJZ1 356 aa8.6□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.6□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 A0A1B0GVM2 712 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 GREM1O60565 184 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 TSPAN3O60637 253 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 CST8O60676 142 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 TBL1XO60907 577 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 NFATC1O95644 943 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 ERCC2P18074 760 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 AMPD1P23109 780 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 HOXC13P31276 330 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 CDH18Q13634 790 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 TUBB2AQ13885 445 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 DPYSQ14117 519 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 GRM2Q14416 872 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 MANEALQ5VSG8 457 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 FBXL22Q6P050 247 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 VITQ6UXI7 678 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 C14orf80Q86SX3 495 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 CFAP52Q8N1V2 620 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 DDI1Q8WTU0 396 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 ATP2A3Q93084 1043 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 BHMTQ93088 406 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 ELSPBP1Q96BH3 223 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 HAUS1Q96CS2 278 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 FAF2Q96CS3 445 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 OTUB2Q96DC9 234 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 MS4A14Q96JA4 679 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 RNF157Q96PX1 679 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 MPP6Q9NZW5 540 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 THEGQ9P2T0 379 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 CDC23Q9UJX2 597 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 NEU3Q9UQ49 428 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-205ENST00000474409 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 DCLK1O15075 740 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 MFSD11O43934 449 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 ECI2O75521 394 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 ADH1CP00326 375 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 RHOCP08134 193 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 IL9P15248 144 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 RHOQP17081 205 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 PSMC3P17980 439 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 TGM2P21980 687 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 HCAR3P49019 387 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 IRAK1P51617 712 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 SGSHP51688 502 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 CDH4P55283 916 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 RPS24P62847 133 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 TFF2Q03403 129 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 HTR4Q13639 388 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 PDGFRLQ15198 375 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 TAZQ16635 292 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 ANO4Q32M45 955 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 MPPE1Q53F39 396 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 SLC9A4Q6AI14 798 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 PARM1Q6UWI2 310 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 BBS12Q6ZW61 710 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 CHST9Q7L1S5 443 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 ZNF354CQ86Y25 554 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 MFSD6LQ8IWD5 586 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 CARNMT1Q8N4J0 409 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CNN3-205ENST00000474409 TTC13Q8NBP0 860 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms