RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473371.1

NHLRC3-204, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene NHLRC3, Length 3,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-204ENST00000473371 TOMM70O94826 608 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 LY6KQ17RY6 165 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 CCDC153Q494R4 210 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 WRNIP1Q96S55 665 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 SERPINI1Q99574 410 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 SNX15Q9NRS6 342 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 DTLQ9NZJ0 730 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 TMCO1Q9UM00 188 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 FZD1Q9UP38 647 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 DNAJA2O60884 412 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 ASLP04424 464 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 GP5P40197 560 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 MLH1P40692 756 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 DPYSL2Q16555 572 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 CXorf38Q8TB03 319 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 ARNTL2Q8WYA1 636 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.076e-7■■■■□ 24.4
NHLRC3-204ENST00000473371 PGBD4Q96DM1 585 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 VPS33BQ9H267 617 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 SYBUQ9NX95 663 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 HESX1Q9UBX0 185 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 STK39Q9UEW8 545 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 LZTS1Q9Y250 596 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 LCTP09848 1927 aa14.6□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 ZNF487B1APH4 448 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 CLCN3P51790 818 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 INCA1Q0VD86 236 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 METTL7BQ6UX53 244 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 MAPK15Q8TD08 544 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 C12orf42Q96LP6 360 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 OR52B2Q96RD2 323 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 LGMNQ99538 433 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 CEP41Q9BYV8 373 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 PHF24Q9UPV7 400 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 TRIP11Q15643 1979 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 ZBTB42B2RXF5 422 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 TFAP2AP05549 437 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 THRAP10827 490 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 DCAF15Q66K64 600 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 SNX32Q86XE0 403 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 EXOC8Q8IYI6 725 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 DCLK2Q8N568 766 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 CNBD2Q96M20 576 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 UBAP1Q9NZ09 502 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.59□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 PEX10O60683 326 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 FBXO21O94952 628 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 CRTAMO95727 393 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 ATP6V1B1P15313 513 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 C16orf89Q6UX73 402 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 LCA5Q86VQ0 697 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 TTC30AQ86WT1 665 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 NETO2Q8NC67 525 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 PPP1R36Q96LQ0 422 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 NAT9Q9BTE0 207 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 GGA3Q9NZ52 723 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.58□□□□□ -0.07
NHLRC3-204ENST00000473371 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NHLRC3-204ENST00000473371 NEMP1O14524 444 aa14.58□□□□□ -0.08
NHLRC3-204ENST00000473371 VILLO15195 856 aa14.58□□□□□ -0.08
NHLRC3-204ENST00000473371 POLBP06746 335 aa14.58□□□□□ -0.08
NHLRC3-204ENST00000473371 PIK3R1P27986 724 aa14.58□□□□□ -0.08
NHLRC3-204ENST00000473371 FLOT2Q14254 428 aa14.58□□□□□ -0.08
NHLRC3-204ENST00000473371 GRTP1Q5TC63 336 aa14.58□□□□□ -0.08
NHLRC3-204ENST00000473371 METTL21CQ5VZV1 264 aa14.58□□□□□ -0.08
NHLRC3-204ENST00000473371 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.58□□□□□ -0.08
NHLRC3-204ENST00000473371 ACOT1Q86TX2 421 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms