RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.44■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 CHST9Q7L1S5 443 aa22.44■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 UCMAQ8WVF2 138 aa22.44■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 ZYG11BQ9C0D3 744 aa22.44■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.44■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXO10Q9UK96 956 aa22.44■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.44■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 ATG13O75143 517 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 L1CAMP32004 1257 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 HTR7P34969 479 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 MESDQ14696 234 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 BOLA3Q53S33 107 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 AHI1Q8N157 1196 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 FIBINQ8TAL6 211 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 IGSF8Q969P0 613 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 CLDN23Q96B33 292 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 RETREG1Q9H6L5 497 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 GGA2Q9UJY4 613 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 TRIOO75962 3097 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 I6L893 689 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 KIF5AQ12840 1032 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC12A1Q13621 1099 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 C5orf22Q49AR2 442 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 RNF43Q68DV7 783 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 C14orf80Q86SX3 495 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 PHTF2Q8N3S3 785 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 ACDQ96AP0 544 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 ABCB8Q9NUT2 735 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 DONSONQ9NYP3 566 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 A0A0A0MRY4 1105 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 DRGXA6NNA5 263 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 TIMM44O43615 452 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 RNF40O75150 1001 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 CISD3P0C7P0 127 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC1A1P43005 524 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 HADHBP55084 474 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 SEC13P55735 322 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 DMC1Q14565 340 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 TEKT4Q8WW24 435 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 MYEOVQ96EZ4 313 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 CHRDQ9H2X0 955 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 ZWILCHQ9H900 591 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 CREB3O43889 395 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 KRT7P08729 469 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 AVPR2P30518 371 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 NUBP1P53384 320 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 TPI1P60174 286 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 DESI2Q9BSY9 194 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 CIPCQ9C0C6 399 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 F5P12259 2224 aa22.39■■□□□ 1.18
RALGPS1-212ENST00000472427 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-212ENST00000472427 K7EQS6 105 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-212ENST00000472427 TRIM24O15164 1050 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-212ENST00000472427 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-212ENST00000472427 DAPK3O43293 454 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-212ENST00000472427 PI15O43692 258 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-212ENST00000472427 SPOPO43791 374 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-212ENST00000472427 LRIG2O94898 1065 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-212ENST00000472427 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-212ENST00000472427 RHOCP08134 193 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-212ENST00000472427 RHOQP17081 205 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-212ENST00000472427 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms