RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466971.1

NFX1-206, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 5

Gene NFX1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-206	ENST00000466971	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	AAAS	Q9NRG9	546 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PIGV	Q9NUD9	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RNF19A	Q9NV58	838 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PTPRD	P23468	1912 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	WASH4P	A8MWX3	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971		I3L4J1	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	DCLK1	O15075	740 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CREB3	O43889	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GDF9	O60383	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ACSL3	O95573	720 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	APOE	P02649	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GALT	P07902	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CLTB	P09497	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CPB1	P15086	417 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ERCC2	P18074	760 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LAG3	P18627	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	YWHAQ	P27348	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RBL1	P28749	1068 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HOXC13	P31276	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CHKA	P35790	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PPM1A	P35813	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MMP13	P45452	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GJA8	P48165	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NDUFV1	P49821	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GNGT1	P63211	74 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FOXK2	Q01167	660 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RING1	Q06587	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	DMTN	Q08495	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GALNT2	Q10471	571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PLD1	Q13393	1074 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NAB1	Q13506	487 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	DPYS	Q14117	519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PRPSAP1	Q14558	356 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KYNU	Q16719	465 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CA9	Q16790	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ANO4	Q32M45	955 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971		Q6ZVU0	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CYS1	Q717R9	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TAC4	Q86UU9	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FATE1	Q969F0	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms