RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 OPHN1O60890 802 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 GOLGA6DP0CG33 693 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 SYN1P17600 705 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 MAGEA6P43360 314 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TUBP50607 506 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 PLD1Q13393 1074 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 FAM182AQ5T1J6 154 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ARTNQ5T4W7 220 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 C9orf72Q96LT7 481 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ETNK1Q9HBU6 452 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 SEPT10Q9P0V9 454 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ZNF840PA6NDX5 716 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 TLL1O43897 1013 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 HMBSP08397 361 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 GARSP41250 739 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 EPHB3P54753 998 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 MTA1Q13330 715 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 HECTD3Q5T447 861 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 FAXCQ5TGI0 409 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 C14orf80Q86SX3 495 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 PDIK1LQ8N165 341 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 LZTR1Q8N653 840 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 NACA2Q9H009 215 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 CENPHQ9H3R5 247 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 DOCK4Q8N1I0 1966 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 SHROOM3Q8TF72 1996 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 ALOX15BO15296 676 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 MTSS1O43312 755 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 METTL18O95568 372 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 COG7P83436 770 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 FNBP1LQ5T0N5 605 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 NUGGCQ68CJ6 796 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 KLHDC10Q6PID8 442 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 LRRC31Q6UY01 552 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 CROCCP2Q86T23 111 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 ZBED8Q8IZ13 594 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 EXOC4Q96A65 974 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 TMEM109Q9BVC6 243 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 NUP205Q92621 2012 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 E7ESA3 106 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 FDFT1P37268 417 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 PPP3CCP48454 512 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 WASHC5Q12768 1159 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 AUHQ13825 339 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa21.93■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 LCHNA4D1U4 455 aa21.93■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 APRTP07741 180 aa21.93■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 ABHD2P08910 425 aa21.93■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 CTNNB1P35222 781 aa21.93■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 ZNF33AQ06730 810 aa21.93■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 SEMA5AQ13591 1074 aa21.93■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.93■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 KCTD16Q68DU8 428 aa21.93■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 TMC7Q7Z402 723 aa21.93■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.93■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 PSMG2Q969U7 264 aa21.93■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa21.93■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 WASH4PA8MWX3 477 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 E7EVH7 732 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 CXCL14O95715 111 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 TPSB2P20231 275 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 GYS2P54840 703 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 TPSAB1Q15661 275 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 MSS51Q4VC12 460 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 AGBL2Q5U5Z8 902 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 ITIH5Q86UX2 942 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 CCDC13Q8IYE1 715 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 ZYG11BQ9C0D3 744 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 MPP6Q9NZW5 540 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-202ENST00000453996 LZTS1Q9Y250 596 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms