RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377526.3

AUP1-201, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AUP1, Length 1,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-201ENST00000377526 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 PDK2Q15119 407 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ALFQ53S48 1182 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 FYB2Q5VWT5 728 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 AADACL2Q6P093 401 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 LRRC31Q6UY01 552 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 PSMB7Q99436 277 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 PLK2Q9NYY3 685 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 TBL1XO60907 577 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.815e-6■■□□□ 11.8
AUP1-201ENST00000377526 NFATC1O95644 943 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 PYGMP11217 842 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 EPHB2P29323 1055 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 DPYSQ14117 519 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 MPPE1Q53F39 396 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 RFX8Q6ZV50 586 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 TTC8Q8TAM2 541 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 FAF2Q96CS3 445 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ZNF670Q9BS34 389 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 BRD9Q9H8M2 597 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ECT2Q9H8V3 914 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 MARK1Q9P0L2 795 aa20.13■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 H3BRJ5 948 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 PENKP01210 267 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ARL4AP40617 200 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 CDKN2BP42772 138 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 RUNX3Q13761 415 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 LLGL1Q15334 1064 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 TAZQ16635 292 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 GAB4Q2WGN9 574 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 DDI1Q8WTU0 396 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 BBS2Q9BXC9 721 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 STIM2Q9P246 746 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.12■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 KCNK3O14649 394 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 HTR7P34969 479 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 HCAR3P49019 387 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ANO4Q32M45 955 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ODF2Q5BJF6 829 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 RNF43Q68DV7 783 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 NLRP14Q86W24 1093 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 DNAI1Q9UI46 699 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 TRIOO75962 3097 aa20.11■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ADH1CP00326 375 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 CYBBP04839 570 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ADH5P11766 374 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 TYRP14679 529 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ERCC2P18074 760 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 AMPD1P23109 780 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 CXCR5P32302 372 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 TDGQ13569 410 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 VSIG1Q86XK7 387 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 CPA6Q8N4T0 437 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 WFDC5Q8TCV5 224 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 RNF157Q96PX1 679 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 A0A1B0GVM2 712 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ZNF487B1APH4 448 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 DCLK1O15075 740 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 KRT10P13645 584 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 RHOQP17081 205 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 ADCY2Q08462 1091 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 MPP7Q5T2T1 576 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 PQLC3Q8N755 202 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 CHFRQ96EP1 664 aa20.1■□□□□ 0.81
AUP1-201ENST00000377526 CARD9Q9H257 536 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms