RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 TNP2Q05952 138 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 SREBF2Q12772 1141 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 MAMLD1Q13495 774 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 SPIDRQ14159 915 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 TFDP1Q14186 410 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 HADHQ16836 314 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 FSCBQ5H9T9 825 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ARMC3Q5W041 872 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 RASAL3Q86YV0 1011 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 RHPN2Q8IUC4 686 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ABRAQ8N0Z2 381 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 NIPA2Q8N8Q9 360 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO36Q8NEA4 188 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 MPP4Q96JB8 637 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ZFP42Q96MM3 310 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PWWP2AQ96N64 755 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 RILPQ96NA2 401 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 CBWD1Q9BRT8 395 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 MRGBPQ9NV56 204 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 THAP1Q9NVV9 213 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 HACD3Q9P035 362 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 SQORQ9Y6N5 450 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CHMP2AO43633 222 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ITGB5P18084 799 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 BGNP21810 368 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 JAK3P52333 1124 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 NR1H2P55055 460 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GPX6P59796 221 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 HPCAP84074 193 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 FSTL1Q12841 308 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 KRT81Q14533 505 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 FAM110CQ1W6H9 321 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CYP2W1Q8TAV3 490 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ACTRT2Q8TDY3 377 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ATP2A3Q93084 1043 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MMP19Q99542 508 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PREBQ9HCU5 417 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PLLPQ9Y342 182 aa7.4□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CILPO75339 1184 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 IFNB1P01574 187 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ARP10275 920 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TGFB3P10600 412 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 FGFR1P11362 822 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 HARSP12081 509 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CD58P19256 250 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GRK2P25098 689 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ICAM3P32942 547 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CCNFP41002 786 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 QARSP47897 775 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TAS2R40P59535 323 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 NOMO3P69849 1222 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 BTKQ06187 659 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CYP24A1Q07973 514 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TRPC3Q13507 836 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PLA2G4FQ68DD2 849 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PRUNE1Q86TP1 453 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 DAW1Q8N136 415 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 NUP93Q8N1F7 819 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GPD1LQ8N335 351 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 IL31RAQ8NI17 732 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PPP4R1Q8TF05 950 aa7.39□□□□□ -1.23
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