RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 KRT81Q14533 505 aa30.51■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC31Q6UY01 552 aa30.51■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 RAPGEF5Q92565 580 aa30.51■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 ATP2A3Q93084 1043 aa30.51■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
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ECHS1-201ENST00000368547 CD48P09326 243 aa30.5■■■□□ 2.47
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ECHS1-201ENST00000368547 TMEM25Q86YD3 366 aa30.5■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 KATNAL2Q8IYT4 538 aa30.5■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 ALG3Q92685 438 aa30.5■■■□□ 2.47
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ECHS1-201ENST00000368547 BRD9Q9H8M2 597 aa30.5■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 HPS4Q9NQG7 708 aa30.5■■■□□ 2.47
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ECHS1-201ENST00000368547 LY6G5CQ5SRR4 150 aa30.49■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 RHBDF2Q6PJF5 856 aa30.49■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 CFAP52Q8N1V2 620 aa30.49■■■□□ 2.47
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ECHS1-201ENST00000368547 KDELR1P24390 212 aa30.48■■■□□ 2.47
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ECHS1-201ENST00000368547 TSC1Q92574 1164 aa30.47■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 ECT2Q9H8V3 914 aa30.47■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 PLK2Q9NYY3 685 aa30.47■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 MPP6Q9NZW5 540 aa30.47■■■□□ 2.47
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ECHS1-201ENST00000368547 H3BRJ5 948 aa30.46■■■□□ 2.47
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ECHS1-201ENST00000368547 CEP104O60308 925 aa30.46■■■□□ 2.47
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ECHS1-201ENST00000368547 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.47
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ECHS1-201ENST00000368547 MMRN1Q13201 1228 aa30.46■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 TDGQ13569 410 aa30.46■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 BBS2Q9BXC9 721 aa30.46■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 STIM2Q9P246 746 aa30.46■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa30.45■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 CNTN5O94779 1100 aa30.45■■■□□ 2.47
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ECHS1-201ENST00000368547 IL4RP24394 825 aa30.45■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 FYB2Q5VWT5 728 aa30.45■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 RFX8Q6ZV50 586 aa30.45■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 RCOR2Q8IZ40 523 aa30.45■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 CPA6Q8N4T0 437 aa30.45■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 TTC8Q8TAM2 541 aa30.45■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 UBXN4Q92575 508 aa30.45■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 MS4A14Q96JA4 679 aa30.45■■■□□ 2.47
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