RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 MAGEB16A2A368 324 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 RAD51CO43502 376 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 BMP10O95393 424 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 EPHX1P07099 455 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 FBXO36Q8NEA4 188 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 NPLOC4Q8TAT6 608 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 HSD17B14Q9BPX1 270 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 KIF13AQ9H1H9 1805 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 A0A088AWK7 358 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF862O60290 1169 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 KRT16P08779 473 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CLCNKBP51801 687 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PPP3CAQ08209 521 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ACAP1Q15027 740 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 C1orf146Q5VVC0 180 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CLEC17AQ6ZS10 378 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 OR5B17Q8NGF7 314 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ACTL9Q8TC94 416 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CLEC4DQ8WXI8 215 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CCDC126Q96EE4 140 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 DUSP16Q9BY84 665 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ING2Q9H160 280 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 OSGEPQ9NPF4 335 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 DNPEPQ9ULA0 475 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PIK3C2AO00443 1686 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 A0A1W2PQH9 124 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 RNF103O00237 685 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 LYPLA2O95372 231 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 SNHG28P0DPA3 235 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 RPL17P18621 184 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PSMD8P48556 350 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 WDR59Q6PJI9 974 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 TFR2Q9UP52 801 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 Q9Y3F1 56 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GLRBP48167 497 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ALDH9A1P49189 494 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ESRRGP62508 458 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 SHDQ96IW2 340 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 HACD1B0YJ81 288 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 TYMPP19971 482 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 SARSP49591 514 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CASP5P51878 434 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 MPP3Q13368 585 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PLEKHA8Q96JA3 519 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 EXO5Q9H790 373 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 MIEF1Q9NQG6 463 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CSHL1Q14406 222 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 TOMM20Q15388 145 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GALNTL6Q49A17 601 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CHST9Q7L1S5 443 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 DET1Q7L5Y6 550 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 FAM162AQ96A26 154 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 VAT1Q99536 393 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PDZD7Q9H5P4 517 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GMIPQ9P107 970 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GABRQQ9UN88 632 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ROBO3Q96MS0 1386 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 DNM1LO00429 736 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ZBTB14O43829 449 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 AGTP01019 485 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CCNG1P51959 295 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GRB14Q14449 540 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 FIGNQ5HY92 759 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 COLGALT2Q8IYK4 626 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF333Q96JL9 665 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CYP4F12Q9HCS2 524 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CNGB3Q9NQW8 809 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 COL20A1Q9P218 1284 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PADI4Q9UM07 663 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 STARD13Q9Y3M8 1113 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 KRT87PA6NCN2 255 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 RAD51BO15315 384 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GJB6O95452 261 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 IL10P22301 178 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CYP2A13Q16696 494 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms