RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 ITGAVP06756 1048 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TUBBP07437 444 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 UQCRHP07919 91 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 RHOQP17081 205 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ATP5OP48047 213 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 GBE1Q04446 702 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 HTR3DQ70Z44 454 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF683Q8IZ20 524 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 SLCO2A1Q92959 643 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC114Q96M63 670 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 WASH4PA8MWX3 477 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 LEFTY2O00292 366 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 NCAM2O15394 837 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 LINC01565O15544 149 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 RBP3P10745 1247 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 MX2P20592 715 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 FSHRP23945 695 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 PDK1Q15118 436 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 LGI2Q8N0V4 545 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TDP1Q9NUW8 608 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 DTLQ9NZJ0 730 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TTI1O43156 1089 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CEBPBP17676 345 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 WEE1P30291 646 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 PTGIRP43119 386 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 PPP1R7Q15435 360 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 C5orf22Q49AR2 442 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CES5AQ6NT32 575 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ITFG1Q8TB96 612 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 WBP2Q969T9 261 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM161BQ96MY7 647 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 RAB17Q9H0T7 212 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 E2F8A0AVK6 867 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CFAP69A5D8W1 941 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 HACD1B0YJ81 288 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 GREM1O60565 184 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 IGFBP4P22692 258 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 MCM3P25205 808 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ZXDBP98169 803 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC7A5Q01650 507 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ARTNQ5T4W7 220 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 Q6ZNB5 142 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 JAMLQ86YT9 394 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TTC16Q8NEE8 873 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ING5Q8WYH8 240 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 RUBCNQ92622 972 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 IGSF8Q969P0 613 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 APOL5Q9BWW9 433 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 MPP6Q9NZW5 540 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 NEU3Q9UQ49 428 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 SGK1O00141 431 aa20.1■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 MFSD11O43934 449 aa20.1■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC6A4P31645 630 aa20.1■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CHKAP35790 457 aa20.1■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ELF2Q15723 593 aa20.1■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.1■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 IFT20Q8IY31 132 aa20.1■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.1■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.1■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TCF3P15923 654 aa20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms