RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 FAM25GB3EWG6 89 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 DUX4L2P0CJ85 424 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 DUX4L3P0CJ86 424 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 DUX4L4P0CJ87 422 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 DUX4L5P0CJ88 424 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 DUX4L6P0CJ89 424 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 DUX4L7P0CJ90 424 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 OR8H2Q8N162 312 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 CPNE1Q99829 537 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 DUX4Q9UBX2 424 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ACKR2O00590 384 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 PTENP60484 403 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF410Q86VK4 478 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 LGALS2P05162 132 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 COPS5Q92905 334 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 TAS2R13Q9NYV9 303 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V1HQ9UI12 483 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 FAM220BPB1ANY3 271 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa22.82■■□□□ 1.24
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PTPRM-201ENST00000332175 KLHL28Q9NXS3 571 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 RECQL4O94761 1208 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 AXLP30530 894 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC153Q494R4 210 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 TCP10LQ8TDR4 215 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 CES2O00748 559 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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PTPRM-201ENST00000332175 EPHX4Q8IUS5 362 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 NMRAL1Q9HBL8 299 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 MIPP30301 263 aa22.81■■□□□ 1.24
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PTPRM-201ENST00000332175 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM79Q9BSE2 394 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 NPY2RP49146 381 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 SLC12A3P55017 1021 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 TOMM20Q15388 145 aa22.81■■□□□ 1.24
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PTPRM-201ENST00000332175 ATAD3BQ5T9A4 648 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 STMN3Q9NZ72 180 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 A0A096LPK6 155 aa22.81■■□□□ 1.24
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PTPRM-201ENST00000332175 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 MMP13P45452 471 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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PTPRM-201ENST00000332175 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 TK2O00142 265 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 XRCC4Q13426 336 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 FGD3Q5JSP0 725 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 WDR93Q6P2C0 686 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ASB7Q9H672 318 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ARMC7Q9H6L4 198 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 RRN3Q9NYV6 651 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
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PTPRM-201ENST00000332175 GP5P40197 560 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 NPNTQ6UXI9 565 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 FUT8Q9BYC5 575 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 FLT3P36888 993 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 VGLL4Q14135 290 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ARMC12Q5T9G4 340 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 MCOLN3Q8TDD5 553 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 PEX1O43933 1283 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 TSC22D2O75157 780 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ABCG1P45844 678 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 EML3Q32P44 896 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 IZUMO2Q6UXV1 221 aa22.8■■□□□ 1.24
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