RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 CRLF3Q8IUI8 442 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 CCNJLQ8IV13 435 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 ZNF781Q8N8C0 355 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 SLC45A3Q96JT2 553 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 GAD1Q99259 594 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 MIOSQ9NXC5 875 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 TK2O00142 265 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 NVLO15381 856 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 KRT38O76015 456 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 FYNP06241 537 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 ITGA2BP08514 1039 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 ERCC2P18074 760 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 TSPAN8P19075 237 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 ATICP31939 592 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 SLC1A6P48664 564 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 OLFML2BQ68BL8 750 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 HPS6Q86YV9 775 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 RNF135Q8IUD6 432 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 DCLK2Q8N568 766 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 FAM156AQ8NDB6 213 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 APPL2Q8NEU8 664 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PPTC7Q8NI37 304 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 SCAMP5Q8TAC9 235 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 GPR152Q8TDT2 470 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 INPP5DQ92835 1189 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 STMN2Q93045 179 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 JCHAINP01591 159 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PRKCHP24723 683 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 GRM5P41594 1212 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 LILRA4P59901 499 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 DEUP1Q05D60 604 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 CTBP1Q13363 440 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PDK2Q15119 407 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 RAPH1Q70E73 1250 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 GPR142Q7Z601 462 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 BEST2Q8NFU1 509 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 WNT8BQ93098 351 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 GORASP1Q9BQQ3 440 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 DDIT4Q9NX09 232 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 SLC39A10Q9ULF5 831 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 C2CD2Q9Y426 696 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 MYADML2A6NDP7 307 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 NEMP2A6NFY4 417 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 FAM159BA6NKW6 160 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 C9IYK1 514 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 DFFAO00273 331 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 AURKAO14965 403 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 CFLARO15519 480 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 POMCP01189 267 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 OR4Q2P0C623 313 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 TGM2P21980 687 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 NMBRP28336 390 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 EPHA3P29320 983 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 CLCNKBP51801 687 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 GJA9P57773 515 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 POU6F1Q14863 301 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 PCLAFQ15004 111 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 DPYSL2Q16555 572 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
GINS1-201ENST00000262460 RPAINQ86UA6 219 aa8.9□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms