RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 EFHC2Q5JST6 749 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 TPGS2Q68CL5 300 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM13CQ8NE31 585 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SLITRK1Q96PX8 696 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SYT15Q9BQS2 421 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SFXN1Q9H9B4 322 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 DZANK1Q9NVP4 752 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 A8MXQ7 604 aa27.14■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 PRRG1O14668 218 aa27.14■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TM9SF1O15321 606 aa27.14■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 SPAG7O75391 227 aa27.14■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ACO1P21399 889 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB2Q96Q27 587 aa27.14■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf70Q9BRQ4 267 aa27.14■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa27.14■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 HAO1Q9UJM8 370 aa27.14■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 A6NHS1 94 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TPBGLP0DKB5 382 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TARSP26639 723 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 NDST1P52848 882 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 VCPP55072 806 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 CUL2Q13617 745 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TCEAL8Q8IYN2 117 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 STKLD1Q8NE28 680 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 DCLRE1BQ9H816 532 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS37BQ9H9H4 285 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 EFR3BQ9Y2G0 817 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 NCOR1O75376 2440 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V1C1P21283 382 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 GCKP35557 465 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPY1Q01534 308 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 GPS1Q13098 491 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 PPM1LQ5SGD2 360 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM171BQ6P995 826 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 LONP2Q86WA8 852 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 DNPEPQ9ULA0 475 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 CALB1P05937 261 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 T-ENOLP0DO92 83 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 BMP1P13497 986 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 PCSK1P29120 753 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 GNA15P30679 374 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR15P49685 360 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 NTHL1P78549 312 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL38Q2WGJ6 581 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF394Q53GI3 561 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 MDH1BQ5I0G3 518 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ACOT1Q86TX2 421 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 SUSD6Q92537 303 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDCD1Q96RS6 583 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS11Q9H270 941 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP69BQ9UJL9 534 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 CDH9Q9ULB4 789 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 INSL5Q9Y5Q6 135 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 NOTCH4Q99466 2003 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 C1RP00736 705 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 P4HA1P13674 534 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 SP100P23497 879 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2F1P24903 491 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 SSR1P43307 286 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR149Q86SP6 731 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf29Q8N999 325 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA18Q8TC71 538 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR152Q8TDT2 470 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKD2Q9BZL6 878 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFATQ9P243 1243 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN5O00501 218 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 LSM8O95777 96 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ACADSP16219 412 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
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CAPNS1-201ENST00000246533 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
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CAPNS1-201ENST00000246533 SDHAF4Q5VUM1 108 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 MYLPFQ96A32 169 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 PCED1BQ96HM7 432 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 POMKQ9H5K3 350 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 CISHQ9NSE2 258 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM191CA6NGB0 347 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT1P04264 644 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD23BP54727 409 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TFDP3Q5H9I0 405 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-201ENST00000246533 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa27.1■■□□□ 1.93
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