RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 GSTM1P09488 218 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 VDRP11473 427 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 GLRA2P23416 452 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 CCDC28BQ9BUN5 200 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 DMTF1Q9Y222 760 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 OGTO15294 1046 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ZSWIM7Q19AV6 140 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ARPINQ7Z6K5 226 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 EFCAB3Q8N7B9 438 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 OR6J1Q8NGC5 347 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 TMEM110Q86TL2 294 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 FAM131BQ86XD5 332 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 TPD52L3Q96J77 140 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 MID1IP1Q9NPA3 183 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 CRLS1Q9UJA2 301 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ITM2BQ9Y287 266 aa10.4□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 PLK1P53350 603 aa10.4□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 IQCKQ8N0W5 287 aa10.4□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 RAD54BQ9Y620 910 aa10.4□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 IL6P05231 212 aa10.4□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa10.4□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PRELID2Q8N945 189 aa10.4□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa10.4□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CLCA2Q9UQC9 943 aa10.4□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 UMODL1Q5DID0 1318 aa10.4□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 A0A0B4J269 797 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 GRIA3P42263 894 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 GPRASP2Q96D09 838 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SPATA16Q9BXB7 569 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SEC24AO95486 1093 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 JCHAINP01591 159 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SERPINA6P08185 405 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CHKAP35790 457 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TMEM139Q8IV31 216 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CEP41Q9BYV8 373 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 KIAA1257Q9ULG3 409 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CENPXA8MT69 81 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 NMRAL1Q9HBL8 299 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ERVK-10P10266 1014 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 RPS6KA3P51812 740 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 BCAT1P54687 386 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 NAB1Q13506 487 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 NOTUMQ6P988 496 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 FAM228AQ86W67 206 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 UXS1Q8NBZ7 420 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 EHD3Q9NZN3 535 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CCDC182A6NF36 153 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 NAMPTP43490 491 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 RPL14P50914 215 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 GPR107Q5VW38 600 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PNMA5Q96PV4 448 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SLC38A7Q9NVC3 462 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 GJB6O95452 261 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ARP10275 920 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ADRA2BP18089 450 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 DPYSL3Q14195 570 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 HHIPL2Q6UWX4 724 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TBC1D19Q8N5T2 526 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TRPC4APQ8TEL6 797 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 BAP1Q92560 729 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ANAPC2Q9UJX6 822 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ADGRB1O14514 1584 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CHADO15335 359 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 GH1P01241 217 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ITFG2Q969R8 447 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 B3GALT6Q96L58 329 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PTPRHQ9HD43 1115 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CDC42EP1Q00587 391 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 LGALS3BPQ08380 585 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ADGRA1Q86SQ6 560 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 FAM13CQ8NE31 585 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PDGFCQ9NRA1 345 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PIGNO95427 931 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CD151P48509 253 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ATP12AP54707 1039 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 FNDC5Q8NAU1 212 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 NT5MQ9NPB1 228 aa10.39□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 FAM9CQ8IZT9 166 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SLITRK1Q96PX8 696 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 RIOX1Q9H6W3 641 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ICAM1P05362 532 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 OSBPL11Q9BXB4 747 aa10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms