RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217971.7

PGRMC1-201, Transcript of progesterone receptor membrane component 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGRMC1, Length 1,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1-201ENST00000217971 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.61□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 TTC13Q8NBP0 860 aa14.61□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 WBP2Q969T9 261 aa14.61□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 AZIN2Q96A70 460 aa14.61□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.61□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 C5orf42Q9H799 3197 aa14.61□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 NUP205Q92621 2012 aa14.61□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 DCLK1O15075 740 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 ACSL4O60488 711 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 ERCC2P18074 760 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 TGM2P21980 687 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 HOXC13P31276 330 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 CHRNA3P32297 505 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 AVPR1AP37288 418 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 SLC11A2P49281 568 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 NPNTQ6UXI9 565 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 GPR149Q86SP6 731 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 ACTL9Q8TC94 416 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 P3H4Q92791 437 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 APOL5Q9BWW9 433 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 STIM2Q9P246 746 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 CEBPBP17676 345 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 TUBB4BP68371 445 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 ZP2Q05996 745 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 SNX1Q13596 522 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 TTC27Q6P3X3 843 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 ITFG1Q8TB96 612 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 ING5Q8WYH8 240 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 UBXN4Q92575 508 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 AMACRQ9UHK6 382 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.6□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 LIASO43766 372 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 GREM1O60565 184 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 KCNJ1P48048 391 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 FNTAP49354 379 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 NOMO1Q15155 1222 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 C8orf74Q6P047 294 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 FBXL22Q6P050 247 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 POTEHQ6S545 545 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 LRRC31Q6UY01 552 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 CHSY1Q86X52 802 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 LATS1O95835 1130 aa14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 TACR2P21452 398 aa14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 SLC6A4P31645 630 aa14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 GBE1Q04446 702 aa14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 ADGRF1Q5T601 910 aa14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 Q6ZNB5 142 aa14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 GJD3Q8N144 294 aa14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 TDP1Q9NUW8 608 aa14.58□□□□□ -0.07
PGRMC1-201ENST00000217971 DTLQ9NZJ0 730 aa14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms