RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592562.1

LMAN1-205, Transcript of lectin, mannose binding 1, human

TSL 2

Gene LMAN1, Length 576 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMAN1-205	ENST00000592562	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	RGS14	O43566	566 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	NFATC1	O95644	943 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	DRD1	P21728	446 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LMAN1-205	ENST00000592562	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	TUSC2	O75896	110 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	WNT1	P04628	370 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	IL1R1	P14778	569 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	PDLIM4	P50479	330 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.08	□□□□□ -1.76	5e-6	■■■■□ 26.7
LMAN1-205	ENST00000592562	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	FRS3	O43559	492 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	SP1	P08047	785 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	DLX5	P56178	289 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	ABAT	P80404	500 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	BUB3	O43684	328 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	HLF	Q16534	295 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	GPSM1	Q86YR5	675 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	GPR78	Q96P69	363 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	LCAT	P04180	440 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	MYB	P10242	640 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	TAF6	P49848	677 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	GPS1	Q13098	491 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	NODAL	Q96S42	347 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	EPYC	Q99645	322 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	ZP1	P60852	638 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	PMPCA	Q10713	525 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMAN1-205	ENST00000592562	CBFB	Q13951	182 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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