RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ORAI3Q9BRQ5 295 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS20P59510 1910 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 TBL1XO60907 577 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV3-27P01718 113 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CD27P26842 260 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 LRMPQ12912 555 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3R6Q5UE93 754 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 TFAP2BQ92481 460 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 IGSF8Q969P0 613 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 H0Y8X5 98 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3R2O00459 728 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PRCPP42785 496 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS7P49802 495 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 MPP7Q5T2T1 576 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO19Q96H55 970 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 LMLNQ96KR4 655 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SGK2Q9HBY8 427 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRBP23467 1997 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 NUMA1Q14980 2115 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV4-34P06331 123 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CCT8P50990 548 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PMS1P54277 932 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
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CAPNS1-211ENST00000590874 PNOCQ13519 176 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 LCLAT1Q6UWP7 414 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC4CQ8WTT0 213 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ITPR1Q14643 2758 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFSF14O43557 240 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGA12O60330 932 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CTSKP43235 329 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 GRK6P43250 576 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC11A2P49281 568 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0895LQ68EN5 471 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 NADSYN1Q6IA69 706 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PMF1Q6P1K2 205 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35F5Q8WV83 523 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA1Q92805 767 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35C1Q96A29 364 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 MYEOVQ96EZ4 313 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSWIM1Q9BR11 485 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 STIM2Q9P246 746 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 DKK4Q9UBT3 224 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SERGEFQ9UGK8 458 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SUN2Q9UH99 717 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 NBEAQ8NFP9 2946 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM149AA5PLN7 773 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSL4O60488 711 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMK2BQ13554 666 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 NUGGCQ68CJ6 796 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD40Q6AI12 368 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 MFN1Q8IWA4 741 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC45BQ8IWX7 931 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT15Q8N3T1 639 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 IRGQQ8WZA9 623 aa26.64■■□□□ 1.86
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CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1257Q9ULG3 409 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 IRAK2O43187 625 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 TBX4P57082 545 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC157Q569K6 752 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM270Q6UE05 265 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC17Q96AE7 1141 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 MRGPRX3Q96LB0 322 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A18Q96N87 628 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 TSG101Q99816 390 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 GDPD2Q9HCC8 539 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM131Q92545 1883 aa26.62■■□□□ 1.85
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CAPNS1-211ENST00000590874 TRABD2BA6NFA1 517 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM47DPA6NHR8 397 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 SIN3BO75182 1162 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CALCAP01258 141 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 LTFP02788 710 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 PAEPP09466 180 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CSKP41240 450 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP4F3Q08477 520 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 USP30Q70CQ3 517 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 FIBINQ8TAL6 211 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 GANCQ8TET4 914 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL12Q9NXK8 326 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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