RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PQF6 199 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 H0Y626 953 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 HSF2BPO75031 334 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFS2O75306 463 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF217O75362 1048 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 GFPT2O94808 682 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV3-27P01718 113 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ERBB2P04626 1255 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 EPHX1P07099 455 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF806P0C7X5 589 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ACADMP11310 421 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 HLA-FP30511 346 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SLC6A4P31645 630 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 P2RY2P41231 377 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 IL12RB1P42701 662 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 KLK7P49862 253 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SGSHP51688 502 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SLC6A3Q01959 620 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 UBXN1Q04323 297 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 TYRO3Q06418 890 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NNTQ13423 1086 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CDH18Q13634 790 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF234Q14588 700 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SYCP1Q15431 976 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 MS4A13Q5J8X5 152 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 MPP7Q5T2T1 576 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 LGI2Q8N0V4 545 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 AHI1Q8N157 1196 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CFAP52Q8N1V2 620 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FRMD1Q8N878 549 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NEK11Q8NG66 645 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 OLIG1Q8TAK6 271 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PIGKQ92643 395 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 C18orf8Q96DM3 657 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 VPS45Q9NRW7 570 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 GGA2Q9UJY4 613 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CKAP5Q14008 2032 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ABCA7Q8IZY2 2146 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 F5H5T6 163 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 F8VZ95 297 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 M0QYT0 321 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 AP5Z1O43299 807 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 GDF9O60383 454 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 MOCS3O95396 460 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 MMEP08473 750 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SLC2A3P11169 496 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFV2P19404 249 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 TACR2P21452 398 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CCR1P32246 355 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CD70P32970 193 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NOS2P35228 1153 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 STAT1P42224 750 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ST8SIA6P61647 398 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 RPS24P62847 133 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FUT11Q495W5 492 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PTPN20Q4JDL3 420 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ANO6Q4KMQ2 910 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PMS2CLQ68D20 193 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM215Q68D42 235 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 MBLAC2Q68D91 279 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 IL31Q6EBC2 164 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NADSYN1Q6IA69 706 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms