RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
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CTDNEP1-210ENST00000574322 VN1R3Q9BXE9 311 aa29.31■■■□□ 2.28
CTDNEP1-210ENST00000574322 CRISPLD1Q9H336 500 aa29.31■■■□□ 2.28
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa29.28■■■□□ 2.28
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa29.28■■■□□ 2.28
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CDH16O75309 829 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-210ENST00000574322 SOD2P04179 222 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF33AQ06730 810 aa29.25■■■□□ 2.27
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