RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567491.1

SH3RF3-AS1-201, SH3RF3 antisense RNA 1, humanhuman

BASIC

Gene SH3RF3-AS1, Length 1,604 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TSPAN3O60637 253 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RWDD2BP57060 319 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TRIM68Q6AZZ1 485 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 FBXL22Q6P050 247 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 NYAP1Q6ZVC0 841 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 C14orf80Q86SX3 495 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CCDC50Q8IVM0 306 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 FAM217AQ8IXS0 508 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 KATNAL2Q8IYT4 538 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 KIAA1958Q8N8K9 716 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RAPGEF5Q92565 580 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ALG3Q92685 438 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 OTUB2Q96DC9 234 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ASIC4Q96FT7 647 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TLR10Q9BXR5 811 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PCDH18Q9HCL0 1135 aa23■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 LRIG2O94898 1065 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CD48P09326 243 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ARL4AP40617 200 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PEX5P50542 639 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TPI1P60174 286 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CPXM2Q8N436 756 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PSMB7Q99436 277 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 GOT1P17174 413 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 KDELR1P24390 212 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 GDI1P31150 447 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SEMA3BQ13214 749 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PDK2Q15119 407 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RABGAP1LQ5R372 815 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 BHMTQ93088 406 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 EBF3Q9H4W6 596 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 KCNK12Q9HB15 430 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DNAI1Q9UI46 699 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 H3BRJ5 948 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ASGR2P07307 311 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SGSHP51688 502 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ARSEP51690 589 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DPYSL3Q14195 570 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PDGFRLQ15198 375 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 EML3Q32P44 896 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CFAP52Q8N1V2 620 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 EXD1Q8NHP7 514 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ATP2A3Q93084 1043 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 NXPE3Q969Y0 559 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 MYEOVQ96EZ4 313 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 KCNK3O14649 394 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 NFATC1O95644 943 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CYBBP04839 570 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ARSAP15289 507 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 EPHB2P29323 1055 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ZP2Q05996 745 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 MMRN1Q13201 1228 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 MANEALQ5VSG8 457 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DDI1Q8WTU0 396 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 IGSF8Q969P0 613 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 BRD9Q9H8M2 597 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SPHK2Q9NRA0 654 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 COL4A3Q01955 1670 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CTAGE9A4FU28 777 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CHADO15335 359 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DAPK3O43293 454 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 IRAK1P51617 712 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RPS24P62847 133 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ANO4Q32M45 955 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ZNF683Q8IZ20 524 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 FAM71BQ8TC56 605 aa22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms