RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	GABBR2	O75899	941 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	FSBP	O95073	299 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	LATS1	O95835	1130 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	CD19	P15391	556 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC6A4	P31645	630 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	GRIA4	P48058	902 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	DAOA	P59103	153 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF445	P59923	1031 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT85	P78386	507 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	UBR7	Q8N806	425 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	MYO19	Q96H55	970 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM149A	A5PLN7	773 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931		H0Y8X5	98 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	PIK3R2	O00459	728 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	CETN3	O15182	167 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	STX10	O60499	249 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	TBL1X	O60907	577 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	ABCB7	O75027	752 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	IGLV3-27	P01718	113 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	DNTT	P04053	509 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	IGHV4-34	P06331	123 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	LCP1	P13796	627 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	CD27	P26842	260 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	IL9R	Q01113	521 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	ZBTB16	Q05516	673 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	TEAD4	Q15561	434 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	TFAP2B	Q92481	460 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	IGSF8	Q969P0	613 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	LMLN	Q96KR4	655 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	FBRS	Q9HAH7	460 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		13.08	□□□□□ -0.31
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PQ27	194 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PQ64	194 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	TNFSF14	O43557	240 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDHGA12	O60330	932 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF202	O95125	648 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	SETSIP	P0DME0	302 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	VDR	P11473	427 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	PRCP	P42785	496 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	CTSK	P43235	329 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	RGS7	P49802	495 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	CCT8	P50990	548 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	LRMP	Q12912	555 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	CAMK2B	Q13554	666 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC157	Q569K6	752 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	SCML4	Q8N228	414 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	SGK2	Q9HBY8	427 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	STIM2	Q9P246	746 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	DKK4	Q9UBT3	224 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	ACSL4	O60488	711 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	SIN3B	O75182	1162 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	CALCA	P01258	141 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	GRK6	P43250	576 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	CYP4F3	Q08477	520 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	PNOC	Q13519	176 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	MPP7	Q5T2T1	576 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	PMF1	Q6P1K2	205 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	MFN1	Q8IWA4	741 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	GOLGA1	Q92805	767 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC6A18	Q96N87	628 aa		13.07	□□□□□ -0.32

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms