RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-208ENST00000551676 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 TAF12Q16514 161 aa26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 PIK3R6Q5UE93 754 aa26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 ITIH5Q86UX2 942 aa26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 IQCKQ8N0W5 287 aa26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 TBC1D31Q96DN5 1066 aa26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 BTN2A3PQ96KV6 586 aa26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 C17orf80Q9BSJ5 609 aa26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 C2orf71A6NGG8 1288 aa26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 CA8P35219 290 aa26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 C9orf50Q5SZB4 431 aa26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 PCGF5Q86SE9 256 aa26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 ZNF683Q8IZ20 524 aa26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 POF1BQ8WVV4 589 aa26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 ACBD3Q9H3P7 528 aa26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 PAK5Q9P286 719 aa26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 C5orf60A6NFR6 353 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 E9PAM4 449 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 NCAM2O15394 837 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 GCATO75600 419 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 ARHGEF15O94989 841 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 SPATA31D3P0C874 917 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 SRGAP2BP0DMP2 458 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 HSD17B3P37058 310 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 SLMAPQ14BN4 828 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 C4orf22Q6V702 233 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 CCDC149Q6ZUS6 474 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 C14orf80Q86SX3 495 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 NPWQ8N729 165 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 KLC2Q9H0B6 622 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 BRD8Q9H0E9 1235 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 TLR9Q9NR96 1032 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-208ENST00000551676 WASH4PA8MWX3 477 aa26.51■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 COCHO43405 550 aa26.51■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 SERPINB6P35237 376 aa26.51■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 NRLP54845 237 aa26.51■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 MS4A13Q5J8X5 152 aa26.51■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 PRDM12Q9H4Q4 367 aa26.51■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa26.51■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 SHOC2Q9UQ13 582 aa26.51■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 HIDE1A8MVS5 230 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 F11P03951 625 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 MYOGP15173 224 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 CHKAP35790 457 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 GALNT2Q10471 571 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 NUGGCQ68CJ6 796 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 TMEM150AQ86TG1 271 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 HOOK3Q86VS8 718 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 KREMEN2Q8NCW0 462 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 LRRN4Q8WUT4 740 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 HTR3CQ8WXA8 447 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 LGMNQ99538 433 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 IL21Q9HBE4 155 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 OGFRQ9NZT2 677 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 SMAPO00193 183 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 C1RP00736 705 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 OAS1P00973 400 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 VAV1P15498 845 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 MX2P20592 715 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 PMS2P54278 862 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 CFAP58Q5T655 872 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 PLPP4Q5VZY2 271 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 TP53INP2Q8IXH6 220 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 PPIL6Q8IXY8 311 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 CCDC33Q8N5R6 958 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 LZTR1Q8N653 840 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 CPT1BQ92523 772 aa26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa26.49■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 GOLGA6BA6NDN3 693 aa26.49■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 GRXCR1A8MXD5 290 aa26.49■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 AGPSO00116 658 aa26.49■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 ACTN2P35609 894 aa26.49■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 AUHQ13825 339 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 SPRED2Q7Z698 418 aa26.49■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 NAT8LQ8N9F0 302 aa26.49■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 HMBSP08397 361 aa26.48■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 COG7P83436 770 aa26.48■■□□□ 1.83
PPP1CC-208ENST00000551676 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms