RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 AMPD1P23109 780 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 AVPR1AP37288 418 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 MTHFRP42898 656 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 AIF1P55008 147 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 KRT81Q14533 505 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 ARL13BQ3SXY8 428 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 ALFQ53S48 1182 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 KAZNQ674X7 775 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 FBXL22Q6P050 247 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 CCDC50Q8IVM0 306 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 RCOR2Q8IZ40 523 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 NPWQ8N729 165 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 ASIC4Q96FT7 647 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 PBKQ96KB5 322 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 ZNF670Q9BS34 389 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 CALN1Q9BXU9 219 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 OSBPL8Q9BZF1 889 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 OR12D3Q9UGF7 316 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 STOML2Q9UJZ1 356 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 SOBPA7XYQ1 873 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 CES2O00748 559 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 DCLK1O15075 740 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 MBTPS2O43462 519 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 TSPAN3O60637 253 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 CNTN5O94779 1100 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 FGGP02679 453 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 TCF3P15923 654 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 WEE1P30291 646 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 HOXC13P31276 330 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 PTPN7P35236 360 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 TPI1P60174 286 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 RPS24P62847 133 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 DYNLT1P63172 113 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 PDK2Q15119 407 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 PPP2R5EQ16537 467 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 NPNTQ6UXI9 565 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 RFX8Q6ZV50 586 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 HTR3DQ70Z44 454 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 NLRP14Q86W24 1093 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 CHSY1Q86X52 802 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 UNC45BQ8IWX7 931 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 LGI2Q8N0V4 545 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 CFAP52Q8N1V2 620 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 PLD5Q8N7P1 536 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 SMARCD2Q92925 531 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 HAUS1Q96CS2 278 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 C1orf74Q96LT6 269 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 RNF157Q96PX1 679 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 KLC2Q9H0B6 622 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 GDE1Q9NZC3 331 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 MPP6Q9NZW5 540 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 CDC23Q9UJX2 597 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.41□□□□□ -1.06
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