RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548863.1

CNOT2-215, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 3

Gene CNOT2, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-215	ENST00000548863	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	PMM1	Q92871	262 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	YY1	P25490	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	PEX2	P28328	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	RASSF2	P50749	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	GPS1	Q13098	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	BFSP2	Q13515	415 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	GBX1	Q14549	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-215	ENST00000548863	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863		F8W8V4	182 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	TPP1	O14773	563 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	THAP12	O43422	761 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	COQ9	O75208	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863		Q0VFX4	171 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863		Q5PR19	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	RHOD	O00212	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	MST1	P26927	711 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	GAD2	Q05329	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	GALE	Q14376	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863		A0A087WYN8	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863		A0A1B0GUV1	79 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	PPP6R2	O75170	966 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	RHCE	P18577	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	CIITA	P33076	1130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	SHB	Q15464	509 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	PHKB	Q93100	1093 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	GPR78	Q96P69	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-215	ENST00000548863	CPA1	P15085	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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