RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541102.1

LTBR-209, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LTBR, Length 1,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-209ENST00000541102 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.77□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.77□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.77□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.77□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.77□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 TMCO5BA8MYB1 307 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 TBL1XO60907 577 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 GRAP2O75791 330 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 GJB6O95452 261 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 LATS1O95835 1130 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 GABRG2P18507 467 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 TNFAIP3P21580 790 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 SLC6A4P31645 630 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 GABRB2P47870 512 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 ARHGAP8P85298 464 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 KIAA1211LQ6NV74 962 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 TAC4Q86UU9 113 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 C11orf74Q86VG3 221 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 ERICH1Q86X53 443 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 XYLT1Q86Y38 959 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 SPC24Q8NBT2 197 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 SORCS1Q8WY21 1168 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 SPACA7Q96KW9 195 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 SYNCQ9H7C4 482 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 STIM2Q9P246 746 aa14.76□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 A0A087X0T9 212 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 GFRA2O00451 464 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 SERPING1P05155 500 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 FAM228BP0C875 321 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 MMP8P22894 467 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 CDC25BP30305 580 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 MPLP40238 635 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 P2RY2P41231 377 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 SGSHP51688 502 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 CENPCQ03188 943 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 DCAF6Q58WW2 860 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 TRNP1Q6NT89 227 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 TRIM72Q6ZMU5 477 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 MON1BQ7L1V2 547 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 BEND5Q7L4P6 421 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 DEFB106AQ8N104 65 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 AZIN2Q96A70 460 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 GABRG3Q99928 467 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 COX16Q9P0S2 106 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 NENFQ9UMX5 172 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 CEP83Q9Y592 693 aa14.75□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 FRYLO94915 3013 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 TIMM44O43615 452 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 GDF9O60383 454 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 APOEP02649 317 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 CCDC172P0C7W6 258 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 ZNF806P0C7X5 589 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 HLA-FP30511 346 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 IL12RB1P42701 662 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 SNX16P57768 344 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 CDK17Q00537 523 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 STARD3Q14849 445 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 PMS2CLQ68D20 193 aa14.74□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 TMEM215Q68D42 235 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms