RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 NADSYN1Q6IA69 706 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 RFWD3Q6PCD5 774 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 POTEHQ6S545 545 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 CTAGE6Q86UF2 777 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 CTAGE4Q8IX94 777 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 NPAS3Q8IXF0 933 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 MAIP1Q8WWC4 291 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM118BQ9BPY3 351 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 F5H5T6 163 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 H3BQ06 376 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 PRAMEF12O95522 483 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 FOSL2P15408 326 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 TACR2P21452 398 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 C2orf54Q08AI8 447 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 SEMA3BQ13214 749 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 TAZQ16635 292 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 C1orf228Q6PIY5 440 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 LGI2Q8N0V4 545 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 TBC1D31Q96DN5 1066 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 NR2E1Q9Y466 385 aa27.35■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 C5orf42Q9H799 3197 aa27.34■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 FBXL22Q6P050 247 aa27.34■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 VSIG1Q86XK7 387 aa27.34■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 SPATA4Q8NEY3 305 aa27.34■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 ARHGEF4Q9NR80 690 aa27.34■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 MPP6Q9NZW5 540 aa27.34■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 EFR3BQ9Y2G0 817 aa27.34■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 HEY1Q9Y5J3 304 aa27.34■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 EYSQ5T1H1 3165 aa27.34■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 TSPAN3O60637 253 aa27.33■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 ERCC2P18074 760 aa27.33■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 ADGRF1Q5T601 910 aa27.33■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 PQLC3Q8N755 202 aa27.33■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 C1orf54Q8WWF1 131 aa27.33■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 FAF2Q96CS3 445 aa27.33■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 MSLNLQ96KJ4 702 aa27.33■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC6A4P31645 630 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 BBS12Q6ZW61 710 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 AZIN2Q96A70 460 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 ETNK2Q9NVF9 386 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF487B1APH4 448 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 MTHFRP42898 656 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 HCAR3P49019 387 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 NPNTQ6UXI9 565 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 HTR3DQ70Z44 454 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 BBS7Q8IWZ6 715 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 KLHL7Q8IXQ5 586 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 CFAP52Q8N1V2 620 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 CD207Q9UJ71 328 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF510Q9Y2H8 683 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 MAP3K6O95382 1288 aa27.31■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 SLU7O95391 586 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 VCPP55072 806 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 SNX1Q13596 522 aa27.31■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 DPYSQ14117 519 aa27.31■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM78AQ5JUQ0 283 aa27.31■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 TMCO3Q6UWJ1 677 aa27.31■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 ATG4AQ8WYN0 398 aa27.31■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 P3H4Q92791 437 aa27.31■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 IGSF8Q969P0 613 aa27.31■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 ZYG11BQ9C0D3 744 aa27.31■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 GDE1Q9NZC3 331 aa27.31■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 GREM1O60565 184 aa27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 KCNA5P22460 613 aa27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 VIPR2P41587 438 aa27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC9A4Q6AI14 798 aa27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 GPR153Q6NV75 609 aa27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC33Q8N5R6 958 aa27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 PLD5Q8N7P1 536 aa27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 NETO2Q8NC67 525 aa27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 CDH7Q9ULB5 785 aa27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 COL19A1Q14993 1142 aa27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 MANEALQ5VSG8 457 aa27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 Q6ZNB5 142 aa27.3■■□□□ 1.96
NDUFS3-211ENST00000533507 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms