RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 SEMA3BQ13214 749 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 APIPQ96GX9 242 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 CLMNQ96JQ2 1002 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 CDH19Q9H159 772 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 CLEC18AA5D8T8 446 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 RGS14O43566 566 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 CLCN5P51795 746 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 GPS2Q13227 327 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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PTPRK-220ENST00000531466 Q5PR19 223 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 RNF220Q5VTB9 566 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 RRAGBQ5VZM2 374 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 ACSM6Q6P461 480 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 RNF44Q7L0R7 432 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 CLEC18CQ8NCF0 446 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 TBC1D14Q9P2M4 693 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 SPRY3O43610 288 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 RFPL1O75677 317 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 PPP1R3DO95685 299 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 CACNB3P54284 484 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 TRAF1Q13077 416 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 GPR18Q14330 331 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 TTC39AQ5SRH9 613 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF347Q96SE7 839 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRK-220ENST00000531466 MAGEH1Q9H213 219 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRK-220ENST00000531466 KCNG2Q9UJ96 466 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 FOXO6A8MYZ6 492 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 NFATC1O95644 943 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 CGAP01215 116 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 KLKB1P03952 638 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 ABATP80404 500 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 COASYQ13057 564 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 C9orf57Q5W0N0 161 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 SPSB3Q6PJ21 355 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 ARMC9Q7Z3E5 817 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 KRT28Q7Z3Y7 464 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-220ENST00000531466 MSLNLQ96KJ4 702 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-220ENST00000531466 F8W8V4 182 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRK-220ENST00000531466 CYB5R4Q7L1T6 521 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 GLMPQ8WWB7 406 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRK-220ENST00000531466 KAT2AQ92830 837 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRK-220ENST00000531466 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 FZD10Q9ULW2 581 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 DENND3A2RUS2 1198 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRK-220ENST00000531466 PPP6R2O75170 966 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRK-220ENST00000531466 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 GSTM5P46439 218 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF718Q3SXZ3 478 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRK-220ENST00000531466 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 OR52N4Q8NGI2 321 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-220ENST00000531466 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 MGEA5O60502 916 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 ARSBP15848 533 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 RASSF2P50749 326 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 KRTAP10-12P60413 245 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 KIF5AQ12840 1032 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 P3H1Q32P28 736 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 FAXCQ5TGI0 409 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 PMM1Q92871 262 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
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