RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526386.5

UBASH3B-203, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 553 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-203ENST00000526386 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.33□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.33□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 COX16Q9P0S2 106 aa7.33□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 STK39Q9UEW8 545 aa7.33□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.33□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 A0A0A0MRY4 1105 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 DRGXA6NNA5 263 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 NCAM2O15394 837 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 MSI1O43347 362 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 CREB3O43889 395 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 TMEM63AO94886 807 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 METTL18O95568 372 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 TBX18O95935 607 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 TSHRP16473 764 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 PPM1AP35813 382 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 MAGEA3P43357 314 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 ARL4CP56559 192 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 TBX4P57082 545 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 TPI1P60174 286 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 CDK16Q00536 496 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 GAD2Q05329 585 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 SEMA5AQ13591 1074 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 KYNUQ16719 465 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 MGAT5BQ3V5L5 792 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 MSS51Q4VC12 460 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 FNBP1LQ5T0N5 605 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 LILRA6Q6PI73 481 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 C14orf80Q86SX3 495 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 CROCCP2Q86T23 111 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 CCDC25Q86WR0 208 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 NPWQ8N729 165 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 GIPC2Q8TF65 315 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 HTR3CQ8WXA8 447 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 HERVK_113Q902F9 699 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 FATE1Q969F0 183 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 PGM2Q96G03 612 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 P2RY11Q96G91 374 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 TMEM169Q96HH4 297 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 SPATA13Q96N96 652 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 TTC25Q96NG3 672 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 YME1L1Q96TA2 773 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 LGMNQ99538 433 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 GDF15Q99988 308 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 PTPRSQ13332 1948 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 CDH23Q9H251 3354 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 NUP205Q92621 2012 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 VCANP13611 3396 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 CLUHO75153 1309 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF840PA6NDX5 716 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 MTSS1O43312 755 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 CACNG3O60359 315 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 TLR5O60602 858 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 OPHN1O60890 802 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 MAP3K6O95382 1288 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 MYZAPP0CAP1 466 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 CSH1P0DML2 217 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 CSH2P0DML3 217 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 CTSAP10619 480 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 TPSB2P20231 275 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 MX2P20592 715 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 EPHB2P29323 1055 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 FDFT1P37268 417 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 SKOR1P84550 965 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 CREMQ03060 361 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-203ENST00000526386 FPGSQ05932 587 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms