RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521038.5

PHF20L1-217, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, human

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 427 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20L1-217	ENST00000521038	DFNA5	O60443	496 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	NDUFS2	O75306	463 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	KATNA1	O75449	491 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRDM1	O75626	825 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	TSPAN9	O75954	239 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	SNAPC5	O75971	98 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	FUCA1	P04066	466 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	SERPINE1	P05121	402 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PLA2G4B	P0C869	781 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	MX2	P20592	715 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	RRM1	P23921	792 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	GCA	P28676	217 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PCSK6	P29122	969 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCR3	P51677	355 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ADCY7	P51828	1080 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	BLVRA	P53004	296 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	CTSW	P56202	376 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	GJA9	P57773	515 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	GABARAPL2	P60520	117 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	MYL6	P60660	151 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	CTAG1A	P78358	180 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PTK7	Q13308	1070 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	AP3B2	Q13367	1082 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	NCOA4	Q13772	614 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PSMD6	Q15008	389 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	CEP55	Q53EZ4	464 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	LPCAT4	Q643R3	524 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	DYM	Q7RTS9	669 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ANKFN1	Q8N957	763 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	RNF169	Q8NCN4	708 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	MZB1	Q8WU39	189 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	SEPT8	Q92599	483 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	KRT35	Q92764	455 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	CEP170P1	Q96L14	293 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	C9orf72	Q96LT7	481 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	FAM20A	Q96MK3	541 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PNMA5	Q96PV4	448 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	NUP85	Q9BW27	656 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ARMT1	Q9H993	441 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	RAB20	Q9NX57	234 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PLLP	Q9Y342	182 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	SLIT2	O94813	1529 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	DCC	P43146	1447 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRR23A	A6NEV1	266 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038		H3BMQ9	156 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	GPR25	O00155	361 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRIM38	O00635	465 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	HAT1	O14929	419 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	ANGPT2	O15123	496 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	MAGEB3	O15480	346 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PDPK1	O15530	556 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	LIAS	O43766	372 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PHF20L1-217	ENST00000521038	GPC4	O75487	556 aa		6.01	□□□□□ -1.45

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