RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM27	P14373	513 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	PTGR1	Q14914	329 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	PMM1	Q92871	262 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF479	Q96JC4	524 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	FZD3	Q9NPG1	666 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	CA14	Q9ULX7	337 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	TNFSF4	P23510	183 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	TM4SF4	P48230	202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	PGGT1B	P53609	377 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	SLC37A1	P57057	533 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	CBFB	Q13951	182 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	CSHL1	Q14406	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	KAT2A	Q92830	837 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	RASA4B	C9J798	803 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057		M0QYT0	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	RHOD	O00212	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	PODXL	O00592	558 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	RASA4	O43374	803 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	NTSR2	O95665	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	MYL3	P08590	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	IGFBP2	P18065	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	TGM2	P21980	687 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	GRM4	Q14833	912 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COPS5-208	ENST00000519057	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057		H0YGN5	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	NKX2-8	O15522	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	SLC28A2	O43868	658 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	IFNA2	P01563	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	NGFR	P08138	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	FOXL2	P58012	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	SHC2	P98077	582 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	ZXDB	P98169	803 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	FAR2	Q96K12	515 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COPS5-208	ENST00000519057	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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