RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518928.1

TSNARE1-203, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSNARE1, Length 940 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-203ENST00000518928 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-203ENST00000518928 PILRBQ9UKJ0 227 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-203ENST00000518928 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-203ENST00000518928 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-203ENST00000518928 PCDH15Q96QU1 1955 aa14.71□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 ACACBO00763 2458 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 CKAP5Q14008 2032 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 A0A1W2PQC6 194 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 E5RJQ4 531 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 KCNK5O95279 499 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 CD70P32970 193 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 KRT9P35527 623 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 STAT1P42224 750 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 PI4KAP42356 2102 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 MAPK8P45983 427 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 UBASH3AP57075 661 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 PDCLQ13371 301 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 NUMA1Q14980 2115 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 PTPRNQ16849 979 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 LYSMD4Q5XG99 296 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 TMEM110Q86TL2 294 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 TAC4Q86UU9 113 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 ADIPOR2Q86V24 386 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 LMLNQ96KR4 655 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 HSPA12BQ96MM6 686 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 CPXM1Q96SM3 734 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 FRYQ5TBA9 3013 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 MMEP08473 750 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 NCAM1P13591 858 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 CHRNB2P17787 502 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 PBX1P40424 430 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 ACADSBP45954 432 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF33AQ06730 810 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 ADGRF1Q5T601 910 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 SYT12Q8IV01 421 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 IRGQQ8WZA9 623 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 BAP1Q92560 729 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 IFNKQ9P0W0 207 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 CACNA1EQ15878 2313 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 TBL1XO60907 577 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 FBXO21O94952 628 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 CFIP05156 583 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 ENGP17813 658 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 TBX4P57082 545 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 ARID5AQ03989 594 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 MPPE1Q53F39 396 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 FSCBQ5H9T9 825 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 NUDT18Q6ZVK8 323 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 CHST9Q7L1S5 443 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 C11orf74Q86VG3 221 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 SLC39A13Q96H72 371 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 STIM2Q9P246 746 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 ACSL4O60488 711 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 GRAP2O75791 330 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 ERBB2P04626 1255 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 CYBBP04839 570 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 EPHX1P07099 455 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 SPINK2P20155 84 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 PMLP29590 882 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 IRAK1P51617 712 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 FMO1Q01740 532 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 CDR2Q01850 454 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 SDE2Q6IQ49 451 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-203ENST00000518928 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms