RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 C8orf48Q96LL4 319 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 LGMNQ99538 433 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 BRD8Q9H0E9 1235 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 WDCPQ9H6R7 721 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SENP1Q9P0U3 644 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 IGSF9Q9P2J2 1179 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
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SH3BP2-209ENST00000504450 CHMP2BQ9UQN3 213 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 RASA4BC9J798 803 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF103O00237 685 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PITPNM1O00562 1244 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 IRAK2O43187 625 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 RASA4O43374 803 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TYROBPO43914 113 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D4O60343 1298 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 OPHN1O60890 802 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 CLTBP09497 229 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4Q2P0C623 313 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 RAG1P15918 1043 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 FGFR3P22607 806 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PRKCHP24723 683 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGEA11P43364 429 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 OR1G1P47890 313 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PGFP49763 221 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC5A3P53794 718 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR4P57081 412 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TPI1P60174 286 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 CDK16Q00536 496 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 GALNT2Q10471 571 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PARP6Q2NL67 630 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC39A12Q504Y0 691 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 BRMS1LQ5PSV4 323 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 CAPN12Q6ZSI9 719 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 CYS1Q717R9 158 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC34Q8IZ02 419 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SEPT8Q92599 483 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 CYTH2Q99418 400 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PAFAH2Q99487 392 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TKTL2Q9H0I9 626 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SMOC2Q9H3U7 446 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TRABDQ9H4I3 376 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 NMUR1Q9HB89 426 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNK9Q9NPC2 374 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCC13Q9NSE7 274 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM51Q9NW97 253 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 MARCH5Q9NX47 278 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 NEU3Q9UQ49 428 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SNX10Q9Y5X0 201 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PTPRDP23468 1912 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PATJQ8NI35 1801 aa11.1□□□□□ -0.63
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SH3BP2-209ENST00000504450 FAM47DPA6NHR8 397 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 OR6C75A6NL08 312 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNU1A8MYU2 1149 aa11.1□□□□□ -0.63
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SH3BP2-209ENST00000504450 ASMTLO95671 621 aa11.1□□□□□ -0.63
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SH3BP2-209ENST00000504450 APRTP07741 180 aa11.1□□□□□ -0.63
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SH3BP2-209ENST00000504450 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 MTM1Q13496 603 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SYCP2LQ5T4T6 812 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 MANEALQ5VSG8 457 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 STEAP4Q687X5 459 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 MSANTD2Q6P1R3 559 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SH2D5Q6ZV89 423 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SRLQ86TD4 932 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa11.1□□□□□ -0.63
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