RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484454.1

TARBP1-208, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene TARBP1, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP1-208	ENST00000484454	GPR78	Q96P69	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PIGS	Q96S52	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CLPB	Q9H078	707 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454		A0A1B0GVC2	190 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454		H7C1Q1	480 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	HOXD12	P35452	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PCP4	P48539	62 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	TUB	P50607	506 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	INHBC	P55103	352 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	COL10A1	Q03692	680 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	DPT	Q07507	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	ESX1	Q8N693	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	STAM	Q92783	540 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SEPT4	O43236	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	KLK10	O43240	276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	C1QL1	O75973	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CD53	P19397	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CYP3A7	P24462	503 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	IDUA	P35475	653 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	MCM2	P49736	904 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SOX10	P56693	466 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CHRND	Q07001	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CDK18	Q07002	472 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	RITA1	Q96K30	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SLPI	P03973	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	IGFBP2	P18065	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF84	P51523	738 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	TLE2	Q04725	743 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	DMWD	Q09019	674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	TRPC3	Q13507	836 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SEC23B	Q15437	767 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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