RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483340.1

KIF1B-208, Transcript of kinesin family member 1B, human

TSL 2

Gene KIF1B, Length 839 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIF1B-208	ENST00000483340	RING1	Q06587	406 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	NME3	Q13232	169 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	MTA1	Q13330	715 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	PPP2R5D	Q14738	602 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	FBXO43	Q4G163	708 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	MPPE1	Q53F39	396 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	C2CD6	Q53TS8	623 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	ADGRF1	Q5T601	910 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	VPS36	Q86VN1	386 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	XYLT1	Q86Y38	959 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	BHMT	Q93088	406 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	CHFR	Q96EP1	664 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	SERPINB11	Q96P15	392 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	BBS2	Q9BXC9	721 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	TRIM5	Q9C035	493 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	RBSN	Q9H1K0	784 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	WDCP	Q9H6R7	721 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	RRN3	Q9NYV6	651 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	COX16	Q9P0S2	106 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	CIT	O14578	2027 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	SCN1A	P35498	2009 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	TRANK1	O15050	2925 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	VWA8	A3KMH1	1905 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340		H0Y858	1186 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	LAMTOR5	O43504	91 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	TIMM44	O43615	452 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	ACSL4	O60488	711 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	TSPAN3	O60637	253 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	KAT7	O95251	611 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	LATS1	O95835	1130 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	EGF	P01133	1207 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	APOE	P02649	317 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	CYP17A1	P05093	508 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	SERPING1	P05155	500 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	CALB1	P05937	261 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	KRT3	P12035	628 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	GZMA	P12544	262 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	TYR	P14679	529 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	PDGFRA	P16234	1089 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	CASP14	P31944	242 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	OPRD1	P41143	372 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	PRKCI	P41743	596 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	GRIA2	P42262	883 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	TNFRSF4	P43489	277 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	CXCL12	P48061	93 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	CENPC	Q03188	943 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	MTAP	Q13126	283 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	ARC	Q7LC44	396 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	TAC4	Q86UU9	113 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	DRC7	Q8IY82	874 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	CPXM2	Q8N436	756 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	SLC39A13	Q96H72	371 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	IER2	Q9BTL4	223 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIF1B-208	ENST00000483340	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms