RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466971.1

NFX1-206, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 5

Gene NFX1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-206	ENST00000466971	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	DDIT4	Q9NX09	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971		A0A0A0MRY4	1105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971		E7ENQ6	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IRAK2	O43187	625 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PSMD3	O43242	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	DGKI	O75912	1065 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	BEST1	O76090	585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	AMH	P03971	560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FYN	P06241	537 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GOT1	P17174	413 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CCR1	P32246	355 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	STX2	P32856	288 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PPP3CC	P48454	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SERPINB4	P48594	390 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LMAN1	P49257	510 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	VPS41	P49754	854 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SLC5A3	P53794	718 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SLC18A1	P54219	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PRR20E	P86478	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PRR20C	P86479	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PRR20D	P86480	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PRR20B	P86481	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PRR20A	P86496	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GPR17	Q13304	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MTFR1	Q15390	333 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FUT10	Q6P4F1	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FAM131B	Q86XD5	332 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CPT1B	Q92523	772 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RNF34	Q969K3	372 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	COL26A1	Q96A83	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HDAC11	Q96DB2	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CASD1	Q96PB1	797 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	OLFM3	Q96PB7	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms